Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q56UQ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q56UQ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q56UQ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q56UQ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q56UQ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q56UQ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q56UQ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q56UQ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q56UQ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q56UQ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q56UQ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q56UQ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q56UQ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q56UQ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q56UQ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q56UQ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q56UQ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q56UQ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q56UQ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q56UQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q56UQ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q56UQ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q56UQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q56UQ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q56UQ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q56UQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q56UQ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q56UQ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q56UQ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q56UQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q56UQ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q56UQ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q56UQ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q56UQ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q56UQ5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q56UQ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q56UQ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q56UQ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q56UQ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q56UQ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q56UQ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q56UQ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q56UQ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q56UQ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q56UQ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q56UQ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q56UQ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q56UQ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q56UQ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q56UQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q56UQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q56UQ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q56UQ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q56UQ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q56UQ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q56UQ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q56UQ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q56UQ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q56UQ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q56UQ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q56UQ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q56UQ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q56UQ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q56UQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q56UQ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q56UQ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q56UQ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q56UQ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q56UQ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q56UQ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q56UQ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q56UQ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q56UQ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q56UQ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q56UQ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q56UQ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q56UQ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q56UQ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q56UQ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q56UQ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q56UQ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q56UQ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q56UQ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q56UQ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q56UQ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q56UQ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q56UQ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q56UQ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q56UQ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q56UQ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q56UQ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q56UQ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q56UQ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q56UQ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q56UQ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q56UQ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q56UQ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q56UQ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q56UQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms