Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF212Q495C1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF212Q495C1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF212Q495C1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF212Q495C1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF212Q495C1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF212Q495C1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF212Q495C1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF212Q495C1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF212Q495C1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF212Q495C1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF212Q495C1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF212Q495C1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF212Q495C1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF212Q495C1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF212Q495C1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF212Q495C1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF212Q495C1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF212Q495C1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF212Q495C1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF212Q495C1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF212Q495C1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212Q495C1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF212Q495C1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF212Q495C1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212Q495C1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF212Q495C1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF212Q495C1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF212Q495C1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF212Q495C1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF212Q495C1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212Q495C1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212Q495C1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF212Q495C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF212Q495C1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF212Q495C1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF212Q495C1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF212Q495C1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms