Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAQ7

VMA21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein VMA21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMA21Q3ZAQ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VMA21Q3ZAQ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VMA21Q3ZAQ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VMA21Q3ZAQ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VMA21Q3ZAQ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VMA21Q3ZAQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VMA21Q3ZAQ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VMA21Q3ZAQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VMA21Q3ZAQ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VMA21Q3ZAQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VMA21Q3ZAQ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMA21Q3ZAQ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VMA21Q3ZAQ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMA21Q3ZAQ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMA21Q3ZAQ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VMA21Q3ZAQ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMA21Q3ZAQ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VMA21Q3ZAQ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMA21Q3ZAQ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VMA21Q3ZAQ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VMA21Q3ZAQ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMA21Q3ZAQ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMA21Q3ZAQ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMA21Q3ZAQ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VMA21Q3ZAQ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMA21Q3ZAQ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VMA21Q3ZAQ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMA21Q3ZAQ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms