Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RTN1Q16799 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RTN1Q16799 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTN1Q16799 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RTN1Q16799 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTN1Q16799 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTN1Q16799 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTN1Q16799 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RTN1Q16799 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RTN1Q16799 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTN1Q16799 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTN1Q16799 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTN1Q16799 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTN1Q16799 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTN1Q16799 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RTN1Q16799 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RTN1Q16799 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN1Q16799 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN1Q16799 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTN1Q16799 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTN1Q16799 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTN1Q16799 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTN1Q16799 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTN1Q16799 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTN1Q16799 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RTN1Q16799 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTN1Q16799 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RTN1Q16799 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTN1Q16799 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RTN1Q16799 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RTN1Q16799 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RTN1Q16799 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RTN1Q16799 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RTN1Q16799 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RTN1Q16799 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RTN1Q16799 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RTN1Q16799 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RTN1Q16799 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RTN1Q16799 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RTN1Q16799 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RTN1Q16799 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RTN1Q16799 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RTN1Q16799 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RTN1Q16799 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RTN1Q16799 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RTN1Q16799 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RTN1Q16799 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RTN1Q16799 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RTN1Q16799 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RTN1Q16799 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RTN1Q16799 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RTN1Q16799 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RTN1Q16799 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RTN1Q16799 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RTN1Q16799 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RTN1Q16799 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RTN1Q16799 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RTN1Q16799 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
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