Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SS18Q15532 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SS18Q15532 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SS18Q15532 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SS18Q15532 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SS18Q15532 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SS18Q15532 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SS18Q15532 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SS18Q15532 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SS18Q15532 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SS18Q15532 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SS18Q15532 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SS18Q15532 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SS18Q15532 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SS18Q15532 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SS18Q15532 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SS18Q15532 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SS18Q15532 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SS18Q15532 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SS18Q15532 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SS18Q15532 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SS18Q15532 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SS18Q15532 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SS18Q15532 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SS18Q15532 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SS18Q15532 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SS18Q15532 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SS18Q15532 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SS18Q15532 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SS18Q15532 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SS18Q15532 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SS18Q15532 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SS18Q15532 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SS18Q15532 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SS18Q15532 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SS18Q15532 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SS18Q15532 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SS18Q15532 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SS18Q15532 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SS18Q15532 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SS18Q15532 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SS18Q15532 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SS18Q15532 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SS18Q15532 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SS18Q15532 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SS18Q15532 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SS18Q15532 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SS18Q15532 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SS18Q15532 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SS18Q15532 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SS18Q15532 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SS18Q15532 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SS18Q15532 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SS18Q15532 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SS18Q15532 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SS18Q15532 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SS18Q15532 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SS18Q15532 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SS18Q15532 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SS18Q15532 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SS18Q15532 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SS18Q15532 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SS18Q15532 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SS18Q15532 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SS18Q15532 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SS18Q15532 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SS18Q15532 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SS18Q15532 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SS18Q15532 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SS18Q15532 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SS18Q15532 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SS18Q15532 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SS18Q15532 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SS18Q15532 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SS18Q15532 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SS18Q15532 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SS18Q15532 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SS18Q15532 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SS18Q15532 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SS18Q15532 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SS18Q15532 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SS18Q15532 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SS18Q15532 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SS18Q15532 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SS18Q15532 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SS18Q15532 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SS18Q15532 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SS18Q15532 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SS18Q15532 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SS18Q15532 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SS18Q15532 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SS18Q15532 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SS18Q15532 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SS18Q15532 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SS18Q15532 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SS18Q15532 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SS18Q15532 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SS18Q15532 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SS18Q15532 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SS18Q15532 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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