Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL19A1Q14993 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL19A1Q14993 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL19A1Q14993 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COL19A1Q14993 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COL19A1Q14993 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
COL19A1Q14993 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
COL19A1Q14993 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL19A1Q14993 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL19A1Q14993 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL19A1Q14993 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
COL19A1Q14993 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL19A1Q14993 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL19A1Q14993 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
COL19A1Q14993 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL19A1Q14993 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
COL19A1Q14993 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COL19A1Q14993 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
COL19A1Q14993 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
COL19A1Q14993 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
COL19A1Q14993 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
COL19A1Q14993 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COL19A1Q14993 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
COL19A1Q14993 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL19A1Q14993 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL19A1Q14993 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
COL19A1Q14993 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
COL19A1Q14993 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL19A1Q14993 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
COL19A1Q14993 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL19A1Q14993 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
COL19A1Q14993 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COL19A1Q14993 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL19A1Q14993 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COL19A1Q14993 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
COL19A1Q14993 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
COL19A1Q14993 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL19A1Q14993 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL19A1Q14993 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL19A1Q14993 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL19A1Q14993 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL19A1Q14993 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL19A1Q14993 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL19A1Q14993 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL19A1Q14993 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL19A1Q14993 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COL19A1Q14993 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL19A1Q14993 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COL19A1Q14993 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL19A1Q14993 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
COL19A1Q14993 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
COL19A1Q14993 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
COL19A1Q14993 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
COL19A1Q14993 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL19A1Q14993 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL19A1Q14993 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
COL19A1Q14993 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COL19A1Q14993 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL19A1Q14993 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL19A1Q14993 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL19A1Q14993 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL19A1Q14993 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL19A1Q14993 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COL19A1Q14993 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COL19A1Q14993 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL19A1Q14993 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COL19A1Q14993 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COL19A1Q14993 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
COL19A1Q14993 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL19A1Q14993 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL19A1Q14993 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
COL19A1Q14993 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
COL19A1Q14993 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL19A1Q14993 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
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