Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LBRQ14739 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LBRQ14739 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LBRQ14739 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LBRQ14739 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LBRQ14739 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LBRQ14739 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LBRQ14739 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LBRQ14739 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LBRQ14739 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LBRQ14739 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LBRQ14739 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LBRQ14739 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LBRQ14739 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LBRQ14739 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LBRQ14739 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LBRQ14739 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LBRQ14739 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LBRQ14739 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LBRQ14739 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LBRQ14739 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LBRQ14739 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LBRQ14739 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LBRQ14739 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBRQ14739 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LBRQ14739 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LBRQ14739 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LBRQ14739 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LBRQ14739 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LBRQ14739 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LBRQ14739 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LBRQ14739 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBRQ14739 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBRQ14739 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LBRQ14739 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBRQ14739 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBRQ14739 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LBRQ14739 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LBRQ14739 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LBRQ14739 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LBRQ14739 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LBRQ14739 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LBRQ14739 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBRQ14739 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBRQ14739 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LBRQ14739 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LBRQ14739 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBRQ14739 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBRQ14739 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBRQ14739 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBRQ14739 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBRQ14739 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBRQ14739 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBRQ14739 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBRQ14739 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBRQ14739 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LBRQ14739 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBRQ14739 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBRQ14739 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBRQ14739 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBRQ14739 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBRQ14739 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBRQ14739 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBRQ14739 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBRQ14739 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBRQ14739 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBRQ14739 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBRQ14739 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LBRQ14739 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBRQ14739 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBRQ14739 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBRQ14739 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBRQ14739 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LBRQ14739 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LBRQ14739 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBRQ14739 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBRQ14739 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBRQ14739 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBRQ14739 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBRQ14739 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBRQ14739 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBRQ14739 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBRQ14739 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBRQ14739 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBRQ14739 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBRQ14739 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBRQ14739 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBRQ14739 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBRQ14739 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBRQ14739 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBRQ14739 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBRQ14739 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBRQ14739 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBRQ14739 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBRQ14739 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBRQ14739 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBRQ14739 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBRQ14739 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBRQ14739 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LBRQ14739 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms