Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE6HQ13956 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE6HQ13956 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE6HQ13956 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6HQ13956 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6HQ13956 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6HQ13956 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6HQ13956 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6HQ13956 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE6HQ13956 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE6HQ13956 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE6HQ13956 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE6HQ13956 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6HQ13956 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6HQ13956 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE6HQ13956 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE6HQ13956 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6HQ13956 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE6HQ13956 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6HQ13956 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE6HQ13956 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6HQ13956 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6HQ13956 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6HQ13956 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6HQ13956 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE6HQ13956 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE6HQ13956 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE6HQ13956 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6HQ13956 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6HQ13956 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE6HQ13956 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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