Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB31Q13636 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB31Q13636 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB31Q13636 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB31Q13636 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB31Q13636 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB31Q13636 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB31Q13636 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB31Q13636 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB31Q13636 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB31Q13636 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB31Q13636 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB31Q13636 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB31Q13636 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB31Q13636 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB31Q13636 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB31Q13636 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB31Q13636 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB31Q13636 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB31Q13636 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB31Q13636 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB31Q13636 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB31Q13636 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB31Q13636 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB31Q13636 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB31Q13636 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB31Q13636 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB31Q13636 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB31Q13636 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB31Q13636 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB31Q13636 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB31Q13636 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB31Q13636 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB31Q13636 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB31Q13636 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB31Q13636 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB31Q13636 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB31Q13636 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB31Q13636 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB31Q13636 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB31Q13636 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB31Q13636 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB31Q13636 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms