Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBB3Q13509 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBB3Q13509 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB3Q13509 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB3Q13509 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB3Q13509 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB3Q13509 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB3Q13509 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB3Q13509 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB3Q13509 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB3Q13509 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB3Q13509 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB3Q13509 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB3Q13509 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBB3Q13509 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB3Q13509 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB3Q13509 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBB3Q13509 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB3Q13509 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUBB3Q13509 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB3Q13509 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB3Q13509 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB3Q13509 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB3Q13509 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB3Q13509 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB3Q13509 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB3Q13509 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB3Q13509 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB3Q13509 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBB3Q13509 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBB3Q13509 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB3Q13509 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB3Q13509 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB3Q13509 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB3Q13509 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB3Q13509 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB3Q13509 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB3Q13509 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBB3Q13509 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBB3Q13509 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB3Q13509 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB3Q13509 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB3Q13509 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBB3Q13509 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB3Q13509 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB3Q13509 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB3Q13509 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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