Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCGB2A2Q13296 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCGB2A2Q13296 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCGB2A2Q13296 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCGB2A2Q13296 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCGB2A2Q13296 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCGB2A2Q13296 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCGB2A2Q13296 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCGB2A2Q13296 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCGB2A2Q13296 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCGB2A2Q13296 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCGB2A2Q13296 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCGB2A2Q13296 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCGB2A2Q13296 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCGB2A2Q13296 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCGB2A2Q13296 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCGB2A2Q13296 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCGB2A2Q13296 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCGB2A2Q13296 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCGB2A2Q13296 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCGB2A2Q13296 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCGB2A2Q13296 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCGB2A2Q13296 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCGB2A2Q13296 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCGB2A2Q13296 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCGB2A2Q13296 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCGB2A2Q13296 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCGB2A2Q13296 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCGB2A2Q13296 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCGB2A2Q13296 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCGB2A2Q13296 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCGB2A2Q13296 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCGB2A2Q13296 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCGB2A2Q13296 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCGB2A2Q13296 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCGB2A2Q13296 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCGB2A2Q13296 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCGB2A2Q13296 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCGB2A2Q13296 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCGB2A2Q13296 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCGB2A2Q13296 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCGB2A2Q13296 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCGB2A2Q13296 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCGB2A2Q13296 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCGB2A2Q13296 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCGB2A2Q13296 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCGB2A2Q13296 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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SCGB2A2Q13296 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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SCGB2A2Q13296 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCGB2A2Q13296 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCGB2A2Q13296 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCGB2A2Q13296 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGB2A2Q13296 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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