Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 522.55■■□□□ 1.21e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.521e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.431e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 515.62■□□□□ 0.091e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.031e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 413.23□□□□□ -0.291e-21■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 38.58□□□□□ -1.046e-19■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 24.97□□□□□ -1.616e-19■■■■■ 68.4
TARDBPQ13148 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 223.06■■□□□ 1.286e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.196e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.076e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-212ENST00000538973 1456 ntTSL 520.82■□□□□ 0.926e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 220.58■□□□□ 0.886e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-206ENST00000535830 963 ntTSL 217.62■□□□□ 0.416e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-209ENST00000537212 821 ntTSL 317.46■□□□□ 0.396e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-217ENST00000541999 537 ntTSL 317.46■□□□□ 0.396e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-207ENST00000536995 4577 ntTSL 216.59■□□□□ 0.256e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-215ENST00000541367 1575 ntTSL 514.92□□□□□ -0.026e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 214.52□□□□□ -0.086e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-213ENST00000540222 1400 ntTSL 513.5□□□□□ -0.256e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-210ENST00000537837 784 ntTSL 513.47□□□□□ -0.256e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.286e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 ATG16L2-216ENST00000541554 295 ntTSL 312.76□□□□□ -0.376e-22■■■■■ 68
TARDBPQ13148 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.357e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.097e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 313.42□□□□□ -0.267e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.817e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.617e-21■■■■■ 67.5
TARDBPQ13148 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 218.97■□□□□ 0.638e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.448e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 313.39□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 67.4
TARDBPQ13148 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 211.32□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 67.1
TARDBPQ13148 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 315.38■□□□□ 0.056e-15■■■■■ 66
TARDBPQ13148 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 SEL1L3-210ENST00000513416 2344 ntTSL 28.79□□□□□ -14e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.214e-58■■■■■ 65.3
TARDBPQ13148 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.384e-18■■■■■ 65.2
TARDBPQ13148 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.144e-18■■■■■ 65.2
TARDBPQ13148 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-18■■■■■ 65.2
TARDBPQ13148 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.514e-18■■■■■ 65.2
TARDBPQ13148 PLEKHA2-202ENST00000518939 669 ntTSL 57.68□□□□□ -1.184e-18■■■■■ 65.2
TARDBPQ13148 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.487e-35■■■■■ 64.5
TARDBPQ13148 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.44e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.064e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.064e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.154e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-215ENST00000576957 1159 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.464e-18■■■■■ 63.7
TARDBPQ13148 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 321.58■■□□□ 1.058e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 215.14■□□□□ 0.018e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.198e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-205ENST00000591668 644 ntTSL 212.29□□□□□ -0.448e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 TRIM65-206ENST00000592642 396 ntTSL 39.47□□□□□ -0.898e-11■■■■■ 63.2
TARDBPQ13148 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.292e-17■■■■■ 63.1
TARDBPQ13148 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-17■■■■■ 63.1
TARDBPQ13148 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 215.27■□□□□ 0.042e-37■■■■■ 63.1
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TARDBPQ13148 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-16■■■■■ 62.4
TARDBPQ13148 BMP2K-206ENST00000507670 1170 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.397e-19■■■■■ 61.8
TARDBPQ13148 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-17■■■■■ 61.8
TARDBPQ13148 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.414e-17■■■■■ 61.8
TARDBPQ13148 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.89□□□□□ -0.514e-17■■■■■ 61.8
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TARDBPQ13148 NPRL3-205ENST00000457916 936 ntTSL 517.04■□□□□ 0.328e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.268e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.158e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-202ENST00000419636 616 ntTSL 515.75■□□□□ 0.118e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.038e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 515.22■□□□□ 0.038e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-204ENST00000456528 794 ntTSL 514.31□□□□□ -0.128e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.188e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 312.76□□□□□ -0.378e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 NPRL3-207ENST00000468260 922 ntTSL 510.91□□□□□ -0.668e-10■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 61.6
TARDBPQ13148 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 61.4
TARDBPQ13148 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-23■■■■■ 61.2
TARDBPQ13148 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-23■■■■■ 61.2
TARDBPQ13148 KLC1-215ENST00000553680 519 ntTSL 28.22□□□□□ -1.095e-31■■■■■ 61
TARDBPQ13148 NUP214-209ENST00000489260 649 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 60.8
TARDBPQ13148 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 313.72□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 35.09□□□□□ -1.591e-323■■■■■ 60.4
TARDBPQ13148 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 60.1
TARDBPQ13148 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 60.1
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