Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MKRN3Q13064 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MKRN3Q13064 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MKRN3Q13064 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MKRN3Q13064 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MKRN3Q13064 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MKRN3Q13064 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
MKRN3Q13064 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
MKRN3Q13064 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
MKRN3Q13064 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MKRN3Q13064 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MKRN3Q13064 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MKRN3Q13064 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MKRN3Q13064 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MKRN3Q13064 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MKRN3Q13064 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MKRN3Q13064 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
MKRN3Q13064 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
MKRN3Q13064 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MKRN3Q13064 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MKRN3Q13064 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MKRN3Q13064 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MKRN3Q13064 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MKRN3Q13064 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MKRN3Q13064 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MKRN3Q13064 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MKRN3Q13064 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MKRN3Q13064 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MKRN3Q13064 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MKRN3Q13064 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
MKRN3Q13064 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MKRN3Q13064 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
MKRN3Q13064 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MKRN3Q13064 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MKRN3Q13064 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MKRN3Q13064 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MKRN3Q13064 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MKRN3Q13064 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MKRN3Q13064 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MKRN3Q13064 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MKRN3Q13064 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MKRN3Q13064 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MKRN3Q13064 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MKRN3Q13064 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MKRN3Q13064 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MKRN3Q13064 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MKRN3Q13064 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MKRN3Q13064 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MKRN3Q13064 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MKRN3Q13064 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MKRN3Q13064 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MKRN3Q13064 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MKRN3Q13064 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MKRN3Q13064 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MKRN3Q13064 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MKRN3Q13064 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MKRN3Q13064 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MKRN3Q13064 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MKRN3Q13064 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MKRN3Q13064 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
MKRN3Q13064 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MKRN3Q13064 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
MKRN3Q13064 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MKRN3Q13064 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MKRN3Q13064 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MKRN3Q13064 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MKRN3Q13064 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MKRN3Q13064 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MKRN3Q13064 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MKRN3Q13064 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
MKRN3Q13064 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MKRN3Q13064 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
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