Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SFSWAPQ12872 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SFSWAPQ12872 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SFSWAPQ12872 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SFSWAPQ12872 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SFSWAPQ12872 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFSWAPQ12872 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SFSWAPQ12872 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SFSWAPQ12872 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SFSWAPQ12872 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFSWAPQ12872 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFSWAPQ12872 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SFSWAPQ12872 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SFSWAPQ12872 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SFSWAPQ12872 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SFSWAPQ12872 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SFSWAPQ12872 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SFSWAPQ12872 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SFSWAPQ12872 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SFSWAPQ12872 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SFSWAPQ12872 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SFSWAPQ12872 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SFSWAPQ12872 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SFSWAPQ12872 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SFSWAPQ12872 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SFSWAPQ12872 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFSWAPQ12872 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SFSWAPQ12872 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SFSWAPQ12872 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SFSWAPQ12872 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFSWAPQ12872 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFSWAPQ12872 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SFSWAPQ12872 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFSWAPQ12872 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFSWAPQ12872 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFSWAPQ12872 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFSWAPQ12872 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SFSWAPQ12872 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SFSWAPQ12872 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFSWAPQ12872 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFSWAPQ12872 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SFSWAPQ12872 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SFSWAPQ12872 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SFSWAPQ12872 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SFSWAPQ12872 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SFSWAPQ12872 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFSWAPQ12872 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFSWAPQ12872 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFSWAPQ12872 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFSWAPQ12872 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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