Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 GORASP2-203ENST00000444801 568 ntTSL 317.58■□□□□ 0.45e-9■■■■■ 44.8
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GRSF1Q12849 GORASP2-209ENST00000493692 951 ntTSL 514.09□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 44.8
GRSF1Q12849 GORASP2-206ENST00000471559 812 ntTSL 48.92□□□□□ -0.985e-9■■■■■ 44.8
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GRSF1Q12849 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.616e-13■■■■■ 43.6
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GRSF1Q12849 DCUN1D2-204ENST00000439909 562 ntTSL 59.87□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 42.6
GRSF1Q12849 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 42.2
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GRSF1Q12849 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 40.4
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GRSF1Q12849 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.118e-12■■■■■ 40.2
GRSF1Q12849 NEDD4L-222ENST00000588494 505 ntTSL 43.04□□□□□ -1.928e-12■■■■■ 40.2
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GRSF1Q12849 DCAF8-206ENST00000440682 501 ntTSL 37.66□□□□□ -1.183e-11■■■■■ 38.5
GRSF1Q12849 EIF4B-204ENST00000549077 885 ntTSL 58.82□□□□□ -16e-37■■■■■ 38.4
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GRSF1Q12849 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 38.3
GRSF1Q12849 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 38.3
GRSF1Q12849 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-11■■■■■ 37.6
GRSF1Q12849 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 37.1
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GRSF1Q12849 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-10■■■■■ 36.8
GRSF1Q12849 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 36.8
GRSF1Q12849 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 36.8
GRSF1Q12849 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 36.8
GRSF1Q12849 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 36.8
GRSF1Q12849 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-10■■■■■ 36.8
GRSF1Q12849 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.054e-45■■■■■ 36.2
GRSF1Q12849 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.594e-45■■■■■ 36.2
GRSF1Q12849 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.732e-10■■■■■ 35.9
GRSF1Q12849 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-10■■■■■ 35.9
GRSF1Q12849 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 55.67□□□□□ -1.52e-10■■■■■ 35.9
GRSF1Q12849 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.369e-10■■■■■ 35.2
GRSF1Q12849 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 34.9
GRSF1Q12849 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 34.9
GRSF1Q12849 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 34.8
GRSF1Q12849 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.064e-11■■■■■ 34.5
GRSF1Q12849 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.154e-11■■■■■ 34.5
GRSF1Q12849 EIF4B-210ENST00000550704 1476 ntTSL 514.95□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 EIF4B-205ENST00000549481 1097 ntTSL 513.82□□□□□ -0.21e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.641e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 28.86□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 EIF4B-209ENST00000550390 871 ntTSL 58.83□□□□□ -11e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 34.3
GRSF1Q12849 FBXL19-206ENST00000562798 299 ntTSL 418.94■□□□□ 0.627e-10■■■■■ 34.2
GRSF1Q12849 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.427e-10■■■■■ 34.2
Retrieved 100 of 3,244 protein–RNA pairs in 32 ms