Protein–RNA interactions for Protein: Q12334

SCM3, Protein SCM3, yeastyeast

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCM3Q12334 PTK1YKL198C 1989 nt11.15□□□□□ -0.62
SCM3Q12334 YHL050CYHL050C 2094 nt11.14□□□□□ -0.63
SCM3Q12334 BDH2YAL061W 1254 nt11.1□□□□□ -0.63
SCM3Q12334 MCH5YOR306C 1566 nt11.07□□□□□ -0.64
SCM3Q12334 TRM9YML014W 840 nt11.04□□□□□ -0.64
SCM3Q12334 SIS1YNL007C 1059 nt11.04□□□□□ -0.64
SCM3Q12334 RSB1YOR049C 1065 nt11.04□□□□□ -0.64
SCM3Q12334 RRT12YCR045C 1476 nt10.99□□□□□ -0.65
SCM3Q12334 ATS1YAL020C 1002 nt10.96□□□□□ -0.65
SCM3Q12334 GFD2YCL036W 1701 nt10.95□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 CCT6YDR188W 1641 nt10.95□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.95□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.95□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 SRB2YHR041C 633 nt10.94□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 YFL054CYFL054C 1941 nt10.92□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 RTS2YOR077W 699 nt10.92□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 ART5YGR068C 1761 nt10.91□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 ALG12YNR030W 1656 nt10.91□□□□□ -0.66
SCM3Q12334 YNL195CYNL195C 786 nt10.89□□□□□ -0.67
SCM3Q12334 SPT8YLR055C 1809 nt10.87□□□□□ -0.67
SCM3Q12334 RPM1RPM1 483 nt10.86□□□□□ -0.67
SCM3Q12334 CUE1YMR264W 612 nt10.84□□□□□ -0.67
SCM3Q12334 HSP60YLR259C 1719 nt10.84□□□□□ -0.67
SCM3Q12334 PET9YBL030C 957 nt10.83□□□□□ -0.68
SCM3Q12334 LSM3YLR438C-A 270 nt10.82□□□□□ -0.68
SCM3Q12334 NCP1YHR042W 2076 nt10.76□□□□□ -0.69
SCM3Q12334 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.75□□□□□ -0.69
SCM3Q12334 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.75□□□□□ -0.69
SCM3Q12334 YIL100WYIL100W 354 nt10.74□□□□□ -0.69
SCM3Q12334 YCH1YGR203W 447 nt10.72□□□□□ -0.69
SCM3Q12334 WWM1YFL010C 636 nt10.66□□□□□ -0.7
SCM3Q12334 GLK1YCL040W 1503 nt10.63□□□□□ -0.71
SCM3Q12334 NAR1YNL240C 1476 nt10.6□□□□□ -0.71
SCM3Q12334 SWE1YJL187C 2460 nt10.59□□□□□ -0.71
SCM3Q12334 FRE6YLL051C 2139 nt10.58□□□□□ -0.72
SCM3Q12334 TIR4YOR009W 1464 nt10.58□□□□□ -0.72
SCM3Q12334 YLR236CYLR236C 324 nt10.57□□□□□ -0.72
SCM3Q12334 YMR057CYMR057C 372 nt10.56□□□□□ -0.72
SCM3Q12334 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.54□□□□□ -0.72
SCM3Q12334 DSK2YMR276W 1122 nt10.52□□□□□ -0.73
SCM3Q12334 LCB1YMR296C 1677 nt10.43□□□□□ -0.74
SCM3Q12334 AAC1YMR056C 930 nt10.42□□□□□ -0.74
SCM3Q12334 YGR021WYGR021W 873 nt10.41□□□□□ -0.74
SCM3Q12334 FUR4YBR021W 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
SCM3Q12334 CMP2YML057W 1815 nt10.37□□□□□ -0.75
SCM3Q12334 PRP4YPR178W 1398 nt10.35□□□□□ -0.75
SCM3Q12334 HOM6YJR139C 1080 nt10.3□□□□□ -0.76
SCM3Q12334 DPS1YLL018C 1674 nt10.29□□□□□ -0.76
SCM3Q12334 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.29□□□□□ -0.76
SCM3Q12334 YEL076CYEL076C 651 nt10.29□□□□□ -0.76
SCM3Q12334 YLR464WYLR464W 651 nt10.29□□□□□ -0.76
SCM3Q12334 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.28□□□□□ -0.76
SCM3Q12334 CYT2YKL087C 675 nt10.27□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 BIO5YNR056C 1686 nt10.26□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 PBP1YGR178C 2169 nt10.25□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 BIO4YNR057C 714 nt10.24□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 PST2YDR032C 597 nt10.22□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 LYS4YDR234W 2082 nt10.22□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 BMT6YLR063W 1098 nt10.21□□□□□ -0.77
SCM3Q12334 HSL7YBR133C 2484 nt10.21□□□□□ -0.78
SCM3Q12334 NPL3YDR432W 1245 nt10.19□□□□□ -0.78
SCM3Q12334 YJL152WYJL152W 360 nt10.18□□□□□ -0.78
SCM3Q12334 SIM1YIL123W 1431 nt10.16□□□□□ -0.78
SCM3Q12334 RKM5YLR137W 1104 nt10.15□□□□□ -0.78
SCM3Q12334 SNF1YDR477W 1902 nt10.12□□□□□ -0.79
SCM3Q12334 MNP1YGL068W 585 nt10.11□□□□□ -0.79
SCM3Q12334 DED1YOR204W 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 HEL2YDR266C 1920 nt10.07□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.07□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 YKR005CYKR005C 1578 nt10.05□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 PCM1YEL058W 1674 nt10.04□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 FMP52YER004W 696 nt10.04□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.04□□□□□ -0.8
SCM3Q12334 NDI1YML120C 1542 nt10.01□□□□□ -0.81
SCM3Q12334 RRD1YIL153W 1182 nt9.99□□□□□ -0.81
SCM3Q12334 CCA1YER168C 1641 nt9.98□□□□□ -0.81
SCM3Q12334 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.98□□□□□ -0.81
SCM3Q12334 YAT1YAR035W 2064 nt9.97□□□□□ -0.81
SCM3Q12334 SHU1YHL006C 453 nt9.97□□□□□ -0.81
SCM3Q12334 IRC24YIR036C 792 nt9.95□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 BSP1YPR171W 1731 nt9.94□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 ERF2YLR246W 1080 nt9.94□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.94□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.94□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 CRR1YLR213C 1269 nt9.92□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 YLR281CYLR281C 468 nt9.92□□□□□ -0.82
SCM3Q12334 RAX1YOR301W 1308 nt9.89□□□□□ -0.83
SCM3Q12334 YGR259CYGR259C 441 nt9.89□□□□□ -0.83
SCM3Q12334 SNF6YHL025W 999 nt9.89□□□□□ -0.83
SCM3Q12334 SNG1YGR197C 1644 nt9.86□□□□□ -0.83
SCM3Q12334 WSC2YNL283C 1512 nt9.85□□□□□ -0.83
SCM3Q12334 SPT20YOL148C 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
SCM3Q12334 RIM8YGL045W 1629 nt9.83□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 HEM12YDR047W 1089 nt9.83□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 ADH2YMR303C 1047 nt9.83□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 SSN3YPL042C 1668 nt9.82□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 CWP1YKL096W 720 nt9.81□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 FMT1YBL013W 1206 nt9.81□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 TCD2YKL027W 1344 nt9.81□□□□□ -0.84
SCM3Q12334 MIC10YCL057C-A 294 nt9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms