Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.07□□□□□ -0.48
YLL054CQ12244 YMR090WYMR090W 684 nt12□□□□□ -0.49
YLL054CQ12244 YOL037CYOL037C 354 nt11.99□□□□□ -0.49
YLL054CQ12244 NPL3YDR432W 1245 nt11.98□□□□□ -0.49
YLL054CQ12244 YOR139CYOR139C 393 nt11.97□□□□□ -0.49
YLL054CQ12244 RPP2AYOL039W 321 nt11.96□□□□□ -0.49
YLL054CQ12244 SDH1YKL148C 1923 nt11.93□□□□□ -0.5
YLL054CQ12244 YDL221WYDL221W 552 nt11.92□□□□□ -0.5
YLL054CQ12244 SIS1YNL007C 1059 nt11.92□□□□□ -0.5
YLL054CQ12244 YJL225CYJL225C 5277 nt11.88□□□□□ -0.51
YLL054CQ12244 CAC2YML102W 1407 nt11.86□□□□□ -0.51
YLL054CQ12244 PTP1YDL230W 1008 nt11.85□□□□□ -0.51
YLL054CQ12244 PCH2YBR186W 1695 nt11.82□□□□□ -0.52
YLL054CQ12244 GUT2YIL155C 1950 nt11.8□□□□□ -0.52
YLL054CQ12244 MCH5YOR306C 1566 nt11.79□□□□□ -0.52
YLL054CQ12244 BOR1YNL275W 1731 nt11.74□□□□□ -0.53
YLL054CQ12244 SCC4YER147C 1875 nt11.74□□□□□ -0.53
YLL054CQ12244 SEC11YIR022W 504 nt11.73□□□□□ -0.53
YLL054CQ12244 ART5YGR068C 1761 nt11.72□□□□□ -0.53
YLL054CQ12244 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.72□□□□□ -0.53
YLL054CQ12244 YCH1YGR203W 447 nt11.7□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 PET9YBL030C 957 nt11.7□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 GFD2YCL036W 1701 nt11.69□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 IRC15YPL017C 1500 nt11.68□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 YJL152WYJL152W 360 nt11.67□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 YLR281CYLR281C 468 nt11.67□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 WHI5YOR083W 888 nt11.67□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 TIR4YOR009W 1464 nt11.67□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 YGR139WYGR139W 339 nt11.66□□□□□ -0.54
YLL054CQ12244 PIB2YGL023C 1908 nt11.62□□□□□ -0.55
YLL054CQ12244 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.62□□□□□ -0.55
YLL054CQ12244 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.62□□□□□ -0.55
YLL054CQ12244 GIS3YLR094C 1509 nt11.61□□□□□ -0.55
YLL054CQ12244 RPM1RPM1 483 nt11.61□□□□□ -0.55
YLL054CQ12244 NME1NME1 340 nt11.58□□□□□ -0.56
YLL054CQ12244 YSC84YHR016C 1407 nt11.58□□□□□ -0.56
YLL054CQ12244 YMR057CYMR057C 372 nt11.57□□□□□ -0.56
YLL054CQ12244 RTS2YOR077W 699 nt11.57□□□□□ -0.56
YLL054CQ12244 PUS2YGL063W 1113 nt11.54□□□□□ -0.56
YLL054CQ12244 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.52□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 YHL050CYHL050C 2094 nt11.5□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.49□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 CUE1YMR264W 612 nt11.48□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 RTF1YGL244W 1677 nt11.47□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 IMP2'YIL154C 1041 nt11.47□□□□□ -0.57
YLL054CQ12244 IDH1YNL037C 1083 nt11.44□□□□□ -0.58
YLL054CQ12244 DSK2YMR276W 1122 nt11.43□□□□□ -0.58
YLL054CQ12244 RRT12YCR045C 1476 nt11.39□□□□□ -0.59
YLL054CQ12244 YIL100WYIL100W 354 nt11.39□□□□□ -0.59
YLL054CQ12244 YLR236CYLR236C 324 nt11.39□□□□□ -0.59
YLL054CQ12244 GBP2YCL011C 1284 nt11.34□□□□□ -0.59
YLL054CQ12244 ALG12YNR030W 1656 nt11.33□□□□□ -0.6
YLL054CQ12244 BOP3YNL042W 1191 nt11.33□□□□□ -0.6
YLL054CQ12244 PTK1YKL198C 1989 nt11.33□□□□□ -0.6
YLL054CQ12244 YNL195CYNL195C 786 nt11.29□□□□□ -0.6
YLL054CQ12244 YPR011CYPR011C 981 nt11.27□□□□□ -0.61
YLL054CQ12244 FMP45YDL222C 930 nt11.25□□□□□ -0.61
YLL054CQ12244 YDR433WYDR433W 441 nt11.24□□□□□ -0.61
YLL054CQ12244 TCD2YKL027W 1344 nt11.24□□□□□ -0.61
YLL054CQ12244 RRD1YIL153W 1182 nt11.18□□□□□ -0.62
YLL054CQ12244 ERV46YAL042W 1248 nt11.18□□□□□ -0.62
YLL054CQ12244 LPX1YOR084W 1164 nt11.16□□□□□ -0.62
YLL054CQ12244 NCP1YHR042W 2076 nt11.13□□□□□ -0.63
YLL054CQ12244 DED1YOR204W 1815 nt11.12□□□□□ -0.63
YLL054CQ12244 FMP52YER004W 696 nt11.12□□□□□ -0.63
YLL054CQ12244 YKR040CYKR040C 504 nt11.12□□□□□ -0.63
YLL054CQ12244 MXR2YCL033C 507 nt11.12□□□□□ -0.63
YLL054CQ12244 YFL054CYFL054C 1941 nt11.07□□□□□ -0.64
YLL054CQ12244 FMT1YBL013W 1206 nt11.03□□□□□ -0.64
YLL054CQ12244 YCL042WYCL042W 360 nt11.03□□□□□ -0.64
YLL054CQ12244 HSL7YBR133C 2484 nt11.02□□□□□ -0.64
YLL054CQ12244 SPT8YLR055C 1809 nt11.02□□□□□ -0.65
YLL054CQ12244 SOR2YDL246C 1074 nt10.99□□□□□ -0.65
YLL054CQ12244 SOR1YJR159W 1074 nt10.99□□□□□ -0.65
YLL054CQ12244 CWP1YKL096W 720 nt10.98□□□□□ -0.65
YLL054CQ12244 PCM1YEL058W 1674 nt10.97□□□□□ -0.65
YLL054CQ12244 ADH2YMR303C 1047 nt10.95□□□□□ -0.66
YLL054CQ12244 HSP60YLR259C 1719 nt10.95□□□□□ -0.66
YLL054CQ12244 NAR1YNL240C 1476 nt10.94□□□□□ -0.66
YLL054CQ12244 FRD1YEL047C 1413 nt10.94□□□□□ -0.66
YLL054CQ12244 SNF6YHL025W 999 nt10.93□□□□□ -0.66
YLL054CQ12244 LCB1YMR296C 1677 nt10.89□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 HEL2YDR266C 1920 nt10.89□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.87□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.87□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 SIM1YIL123W 1431 nt10.86□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 SPP1YPL138C 1062 nt10.86□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 CMP2YML057W 1815 nt10.84□□□□□ -0.67
YLL054CQ12244 SSN3YPL042C 1668 nt10.82□□□□□ -0.68
YLL054CQ12244 SWE1YJL187C 2460 nt10.79□□□□□ -0.68
YLL054CQ12244 YIH1YCR059C 777 nt10.79□□□□□ -0.68
YLL054CQ12244 BIO4YNR057C 714 nt10.79□□□□□ -0.68
YLL054CQ12244 RNQ1YCL028W 1218 nt10.78□□□□□ -0.68
YLL054CQ12244 MET2YNL277W 1461 nt10.78□□□□□ -0.68
YLL054CQ12244 YAT1YAR035W 2064 nt10.77□□□□□ -0.69
YLL054CQ12244 SFP1YLR403W 2052 nt10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.3 ms