Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 RPP2AYOL039W 321 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 WHI5YOR083W 888 nt13.26□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.21□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 SSA4YER103W 1929 nt13.18□□□□□ -0.3
SLX4Q12098 CAC2YML102W 1407 nt13.18□□□□□ -0.3
SLX4Q12098 PUS2YGL063W 1113 nt13.15□□□□□ -0.3
SLX4Q12098 TIR4YOR009W 1464 nt13.14□□□□□ -0.31
SLX4Q12098 ART5YGR068C 1761 nt13.13□□□□□ -0.31
SLX4Q12098 PAC11YDR488C 1602 nt13.1□□□□□ -0.31
SLX4Q12098 YCH1YGR203W 447 nt13.09□□□□□ -0.31
SLX4Q12098 GFD2YCL036W 1701 nt13.09□□□□□ -0.31
SLX4Q12098 EMI2YDR516C 1503 nt13.08□□□□□ -0.31
SLX4Q12098 YJL152WYJL152W 360 nt13.06□□□□□ -0.32
SLX4Q12098 PET9YBL030C 957 nt13.03□□□□□ -0.32
SLX4Q12098 YPR011CYPR011C 981 nt13.03□□□□□ -0.32
SLX4Q12098 YDL221WYDL221W 552 nt13□□□□□ -0.33
SLX4Q12098 NVJ2YPR091C 2313 nt12.99□□□□□ -0.33
SLX4Q12098 YLR236CYLR236C 324 nt12.99□□□□□ -0.33
SLX4Q12098 YMR057CYMR057C 372 nt12.98□□□□□ -0.33
SLX4Q12098 IRC15YPL017C 1500 nt12.98□□□□□ -0.33
SLX4Q12098 DSK2YMR276W 1122 nt12.95□□□□□ -0.34
SLX4Q12098 RTS2YOR077W 699 nt12.92□□□□□ -0.34
SLX4Q12098 YMR090WYMR090W 684 nt12.9□□□□□ -0.34
SLX4Q12098 IMP2'YIL154C 1041 nt12.89□□□□□ -0.35
SLX4Q12098 GIS3YLR094C 1509 nt12.87□□□□□ -0.35
SLX4Q12098 YBR220CYBR220C 1683 nt12.86□□□□□ -0.35
SLX4Q12098 FPS1YLL043W 2010 nt12.84□□□□□ -0.35
SLX4Q12098 SDH1YKL148C 1923 nt12.84□□□□□ -0.35
SLX4Q12098 IDH1YNL037C 1083 nt12.83□□□□□ -0.36
SLX4Q12098 FMP45YDL222C 930 nt12.82□□□□□ -0.36
SLX4Q12098 CUE1YMR264W 612 nt12.78□□□□□ -0.36
SLX4Q12098 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.78□□□□□ -0.36
SLX4Q12098 SCC4YER147C 1875 nt12.76□□□□□ -0.37
SLX4Q12098 GBP2YCL011C 1284 nt12.76□□□□□ -0.37
SLX4Q12098 LPX1YOR084W 1164 nt12.75□□□□□ -0.37
SLX4Q12098 ERV46YAL042W 1248 nt12.72□□□□□ -0.37
SLX4Q12098 BDF1YLR399C 2061 nt12.69□□□□□ -0.38
SLX4Q12098 YDR433WYDR433W 441 nt12.68□□□□□ -0.38
SLX4Q12098 MXR2YCL033C 507 nt12.66□□□□□ -0.38
SLX4Q12098 RRD1YIL153W 1182 nt12.65□□□□□ -0.38
SLX4Q12098 DED1YOR204W 1815 nt12.65□□□□□ -0.39
SLX4Q12098 YKR040CYKR040C 504 nt12.6□□□□□ -0.39
SLX4Q12098 TCD2YKL027W 1344 nt12.59□□□□□ -0.39
SLX4Q12098 YIL100WYIL100W 354 nt12.56□□□□□ -0.4
SLX4Q12098 SPP1YPL138C 1062 nt12.54□□□□□ -0.4
SLX4Q12098 FMT1YBL013W 1206 nt12.53□□□□□ -0.4
SLX4Q12098 TAT1YBR069C 1860 nt12.52□□□□□ -0.41
SLX4Q12098 RRT12YCR045C 1476 nt12.46□□□□□ -0.41
SLX4Q12098 FRD1YEL047C 1413 nt12.45□□□□□ -0.42
SLX4Q12098 YSC84YHR016C 1407 nt12.45□□□□□ -0.42
SLX4Q12098 YHL050CYHL050C 2094 nt12.44□□□□□ -0.42
SLX4Q12098 FMP52YER004W 696 nt12.4□□□□□ -0.42
SLX4Q12098 SOR2YDL246C 1074 nt12.39□□□□□ -0.43
SLX4Q12098 SOR1YJR159W 1074 nt12.39□□□□□ -0.43
SLX4Q12098 YNL195CYNL195C 786 nt12.36□□□□□ -0.43
SLX4Q12098 ADH2YMR303C 1047 nt12.34□□□□□ -0.43
SLX4Q12098 CWP1YKL096W 720 nt12.33□□□□□ -0.44
SLX4Q12098 YCL042WYCL042W 360 nt12.33□□□□□ -0.44
SLX4Q12098 SEC11YIR022W 504 nt12.31□□□□□ -0.44
SLX4Q12098 PCM1YEL058W 1674 nt12.3□□□□□ -0.44
SLX4Q12098 RTG1YOL067C 534 nt12.29□□□□□ -0.44
SLX4Q12098 PCH2YBR186W 1695 nt12.28□□□□□ -0.44
SLX4Q12098 GUT2YIL155C 1950 nt12.23□□□□□ -0.45
SLX4Q12098 PTH1YHR189W 573 nt12.22□□□□□ -0.45
SLX4Q12098 SNF6YHL025W 999 nt12.19□□□□□ -0.46
SLX4Q12098 MRPL8YJL063C 717 nt12.18□□□□□ -0.46
SLX4Q12098 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.16□□□□□ -0.46
SLX4Q12098 YEL076CYEL076C 651 nt12.16□□□□□ -0.46
SLX4Q12098 YLR464WYLR464W 651 nt12.16□□□□□ -0.46
SLX4Q12098 LCB1YMR296C 1677 nt12.14□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 PIB2YGL023C 1908 nt12.13□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 NCP1YHR042W 2076 nt12.12□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 YIH1YCR059C 777 nt12.11□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 YLR235CYLR235C 399 nt12.1□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 DIC1YLR348C 897 nt12.09□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 BIO4YNR057C 714 nt12.09□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 RNQ1YCL028W 1218 nt12.09□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 SIM1YIL123W 1431 nt12.09□□□□□ -0.47
SLX4Q12098 YKL030WYKL030W 606 nt12.06□□□□□ -0.48
SLX4Q12098 ADO1YJR105W 1023 nt12.04□□□□□ -0.48
SLX4Q12098 RTF1YGL244W 1677 nt12.02□□□□□ -0.49
SLX4Q12098 YLL053CYLL053C 459 nt12.01□□□□□ -0.49
SLX4Q12098 BOP3YNL042W 1191 nt11.99□□□□□ -0.49
SLX4Q12098 TIM23YNR017W 669 nt11.99□□□□□ -0.49
SLX4Q12098 UME6YDR207C 2511 nt11.97□□□□□ -0.49
SLX4Q12098 HUA1YGR268C 597 nt11.96□□□□□ -0.49
SLX4Q12098 FTR1YER145C 1215 nt11.93□□□□□ -0.5
SLX4Q12098 YLR179CYLR179C 606 nt11.92□□□□□ -0.5
SLX4Q12098 LYS4YDR234W 2082 nt11.91□□□□□ -0.5
SLX4Q12098 PTK1YKL198C 1989 nt11.9□□□□□ -0.5
SLX4Q12098 GAL1YBR020W 1587 nt11.89□□□□□ -0.51
SLX4Q12098 WSC2YNL283C 1512 nt11.89□□□□□ -0.51
SLX4Q12098 ATF2YGR177C 1608 nt11.87□□□□□ -0.51
SLX4Q12098 TRM5YHR070W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
SLX4Q12098 AHT1YHR093W 549 nt11.85□□□□□ -0.51
SLX4Q12098 CRR1YLR213C 1269 nt11.84□□□□□ -0.51
SLX4Q12098 ERF2YLR246W 1080 nt11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms