Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPPLY1Q0D2K3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RIPPLY1Q0D2K3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPPLY1Q0D2K3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPPLY1Q0D2K3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPPLY1Q0D2K3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPPLY1Q0D2K3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPPLY1Q0D2K3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPPLY1Q0D2K3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPPLY1Q0D2K3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPPLY1Q0D2K3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPPLY1Q0D2K3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPPLY1Q0D2K3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPPLY1Q0D2K3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPPLY1Q0D2K3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPPLY1Q0D2K3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPPLY1Q0D2K3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPPLY1Q0D2K3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPPLY1Q0D2K3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPPLY1Q0D2K3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPPLY1Q0D2K3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPPLY1Q0D2K3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPPLY1Q0D2K3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPPLY1Q0D2K3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPPLY1Q0D2K3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPPLY1Q0D2K3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms