Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOX4Q06945 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOX4Q06945 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SOX4Q06945 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SOX4Q06945 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SOX4Q06945 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SOX4Q06945 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SOX4Q06945 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SOX4Q06945 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SOX4Q06945 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOX4Q06945 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOX4Q06945 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOX4Q06945 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOX4Q06945 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOX4Q06945 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SOX4Q06945 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SOX4Q06945 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SOX4Q06945 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SOX4Q06945 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SOX4Q06945 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOX4Q06945 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SOX4Q06945 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SOX4Q06945 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SOX4Q06945 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SOX4Q06945 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SOX4Q06945 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SOX4Q06945 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SOX4Q06945 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SOX4Q06945 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SOX4Q06945 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SOX4Q06945 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SOX4Q06945 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SOX4Q06945 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SOX4Q06945 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SOX4Q06945 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOX4Q06945 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SOX4Q06945 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SOX4Q06945 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SOX4Q06945 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SOX4Q06945 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOX4Q06945 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOX4Q06945 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOX4Q06945 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SOX4Q06945 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SOX4Q06945 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SOX4Q06945 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SOX4Q06945 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SOX4Q06945 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SOX4Q06945 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SOX4Q06945 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOX4Q06945 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SOX4Q06945 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOX4Q06945 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOX4Q06945 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SOX4Q06945 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SOX4Q06945 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SOX4Q06945 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SOX4Q06945 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SOX4Q06945 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOX4Q06945 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SOX4Q06945 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SOX4Q06945 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOX4Q06945 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOX4Q06945 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOX4Q06945 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SOX4Q06945 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SOX4Q06945 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SOX4Q06945 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SOX4Q06945 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SOX4Q06945 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOX4Q06945 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SOX4Q06945 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOX4Q06945 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 868.9 ms