Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNX1T1Q06455 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNX1T1Q06455 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNX1T1Q06455 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNX1T1Q06455 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNX1T1Q06455 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNX1T1Q06455 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNX1T1Q06455 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNX1T1Q06455 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNX1T1Q06455 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNX1T1Q06455 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNX1T1Q06455 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNX1T1Q06455 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNX1T1Q06455 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNX1T1Q06455 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX1T1Q06455 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RUNX1T1Q06455 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNX1T1Q06455 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNX1T1Q06455 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNX1T1Q06455 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNX1T1Q06455 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUNX1T1Q06455 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNX1T1Q06455 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNX1T1Q06455 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNX1T1Q06455 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNX1T1Q06455 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNX1T1Q06455 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNX1T1Q06455 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNX1T1Q06455 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNX1T1Q06455 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUNX1T1Q06455 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUNX1T1Q06455 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNX1T1Q06455 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX1T1Q06455 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX1T1Q06455 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX1T1Q06455 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX1T1Q06455 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms