Protein–RNA interactions for Protein: Q05789

ATG38, Autophagy-related protein 38, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG38Q05789 PTP1YDL230W 1008 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG38Q05789 YOL037CYOL037C 354 nt11.61□□□□□ -0.55
ATG38Q05789 CAC2YML102W 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
ATG38Q05789 YCH1YGR203W 447 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG38Q05789 PET9YBL030C 957 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG38Q05789 YBR220CYBR220C 1683 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG38Q05789 SDH1YKL148C 1923 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG38Q05789 ART5YGR068C 1761 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG38Q05789 NPL3YDR432W 1245 nt11.53□□□□□ -0.56
ATG38Q05789 YJL225CYJL225C 5277 nt11.52□□□□□ -0.57
ATG38Q05789 GFD2YCL036W 1701 nt11.49□□□□□ -0.57
ATG38Q05789 BDF1YLR399C 2061 nt11.48□□□□□ -0.57
ATG38Q05789 SCC4YER147C 1875 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG38Q05789 IRC15YPL017C 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG38Q05789 YJL152WYJL152W 360 nt11.44□□□□□ -0.58
ATG38Q05789 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.42□□□□□ -0.58
ATG38Q05789 TIR4YOR009W 1464 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG38Q05789 RTS2YOR077W 699 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG38Q05789 GIS3YLR094C 1509 nt11.4□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 TAT1YBR069C 1860 nt11.38□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 CUE1YMR264W 612 nt11.36□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 YMR057CYMR057C 372 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 YOR139CYOR139C 393 nt11.35□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 SEC11YIR022W 504 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG38Q05789 YIL100WYIL100W 354 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG38Q05789 YNL195CYNL195C 786 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG38Q05789 YLR236CYLR236C 324 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG38Q05789 WHI5YOR083W 888 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG38Q05789 YLR281CYLR281C 468 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG38Q05789 RPM1RPM1 483 nt11.21□□□□□ -0.61
ATG38Q05789 IDH1YNL037C 1083 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG38Q05789 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG38Q05789 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG38Q05789 YSC84YHR016C 1407 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG38Q05789 PCH2YBR186W 1695 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG38Q05789 IMP2'YIL154C 1041 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG38Q05789 PUS2YGL063W 1113 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 GUT2YIL155C 1950 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 GBP2YCL011C 1284 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 DSK2YMR276W 1122 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 RRT12YCR045C 1476 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 UME6YDR207C 2511 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 YHL050CYHL050C 2094 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG38Q05789 TCD2YKL027W 1344 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 FMP52YER004W 696 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 BOP3YNL042W 1191 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG38Q05789 RTF1YGL244W 1677 nt10.94□□□□□ -0.66
ATG38Q05789 YDR433WYDR433W 441 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG38Q05789 RRD1YIL153W 1182 nt10.88□□□□□ -0.67
ATG38Q05789 YCL042WYCL042W 360 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG38Q05789 FMP45YDL222C 930 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG38Q05789 ERV46YAL042W 1248 nt10.79□□□□□ -0.68
ATG38Q05789 DED1YOR204W 1815 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG38Q05789 PCM1YEL058W 1674 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 SNF6YHL025W 999 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 YKR040CYKR040C 504 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 CWP1YKL096W 720 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 PIB2YGL023C 1908 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 SIM1YIL123W 1431 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 MXR2YCL033C 507 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 SOR2YDL246C 1074 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 SOR1YJR159W 1074 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 MOT3YMR070W 1473 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 LPX1YOR084W 1164 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 YPR011CYPR011C 981 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG38Q05789 ADH2YMR303C 1047 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG38Q05789 FMT1YBL013W 1206 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG38Q05789 LCB1YMR296C 1677 nt10.68□□□□□ -0.7
ATG38Q05789 NCP1YHR042W 2076 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG38Q05789 PTK1YKL198C 1989 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG38Q05789 BIO4YNR057C 714 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG38Q05789 YFL054CYFL054C 1941 nt10.59□□□□□ -0.71
ATG38Q05789 FRD1YEL047C 1413 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG38Q05789 ERF2YLR246W 1080 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG38Q05789 YIH1YCR059C 777 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG38Q05789 RNQ1YCL028W 1218 nt10.55□□□□□ -0.72
ATG38Q05789 YLL053CYLL053C 459 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG38Q05789 DIC1YLR348C 897 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG38Q05789 YLR235CYLR235C 399 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG38Q05789 YFL067WYFL067W 528 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG38Q05789 SPT8YLR055C 1809 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 CRR1YLR213C 1269 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 AQY1YPR192W 918 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 LYS4YDR234W 2082 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 FTR1YER145C 1215 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 DDR2YOL052C-A 186 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 HEM12YDR047W 1089 nt10.41□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 FRE6YLL051C 2139 nt10.4□□□□□ -0.74
ATG38Q05789 PTH1YHR189W 573 nt10.38□□□□□ -0.75
ATG38Q05789 GAL1YBR020W 1587 nt10.36□□□□□ -0.75
ATG38Q05789 TIM23YNR017W 669 nt10.36□□□□□ -0.75
ATG38Q05789 TRM5YHR070W 1500 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG38Q05789 ATF2YGR177C 1608 nt10.34□□□□□ -0.75
ATG38Q05789 YLR179CYLR179C 606 nt10.34□□□□□ -0.75
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