Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 PTP1YDL230W 1008 nt11.24□□□□□ -0.61
SPC19Q03954 CAC2YML102W 1407 nt11.2□□□□□ -0.62
SPC19Q03954 RKM5YLR137W 1104 nt11.19□□□□□ -0.62
SPC19Q03954 YBR220CYBR220C 1683 nt11.16□□□□□ -0.62
SPC19Q03954 SDH1YKL148C 1923 nt11.13□□□□□ -0.63
SPC19Q03954 NVJ2YPR091C 2313 nt11.11□□□□□ -0.63
SPC19Q03954 ART5YGR068C 1761 nt11.09□□□□□ -0.63
SPC19Q03954 TAT1YBR069C 1860 nt11.08□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 GFD2YCL036W 1701 nt11.07□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 YCH1YGR203W 447 nt11.06□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 PET9YBL030C 957 nt11.06□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 SCC4YER147C 1875 nt11.06□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 IRC15YPL017C 1500 nt11.04□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 YOL037CYOL037C 354 nt11.03□□□□□ -0.64
SPC19Q03954 RTS2YOR077W 699 nt11.02□□□□□ -0.65
SPC19Q03954 YJL225CYJL225C 5277 nt10.99□□□□□ -0.65
SPC19Q03954 GIS3YLR094C 1509 nt10.99□□□□□ -0.65
SPC19Q03954 TIR4YOR009W 1464 nt10.98□□□□□ -0.65
SPC19Q03954 NPL3YDR432W 1245 nt10.95□□□□□ -0.66
SPC19Q03954 YJL152WYJL152W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
SPC19Q03954 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.92□□□□□ -0.66
SPC19Q03954 YMR057CYMR057C 372 nt10.91□□□□□ -0.66
SPC19Q03954 CUE1YMR264W 612 nt10.91□□□□□ -0.66
SPC19Q03954 SEC11YIR022W 504 nt10.9□□□□□ -0.66
SPC19Q03954 PAC11YDR488C 1602 nt10.88□□□□□ -0.67
SPC19Q03954 YIL100WYIL100W 354 nt10.87□□□□□ -0.67
SPC19Q03954 FRE6YLL051C 2139 nt10.85□□□□□ -0.67
SPC19Q03954 YNL195CYNL195C 786 nt10.85□□□□□ -0.67
SPC19Q03954 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.85□□□□□ -0.67
SPC19Q03954 YLR236CYLR236C 324 nt10.82□□□□□ -0.68
SPC19Q03954 YOR139CYOR139C 393 nt10.82□□□□□ -0.68
SPC19Q03954 PCH2YBR186W 1695 nt10.81□□□□□ -0.68
SPC19Q03954 YSC84YHR016C 1407 nt10.8□□□□□ -0.68
SPC19Q03954 WHI5YOR083W 888 nt10.74□□□□□ -0.69
SPC19Q03954 GUT2YIL155C 1950 nt10.72□□□□□ -0.69
SPC19Q03954 YLR281CYLR281C 468 nt10.7□□□□□ -0.7
SPC19Q03954 RRT12YCR045C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
SPC19Q03954 IDH1YNL037C 1083 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC19Q03954 YHL050CYHL050C 2094 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC19Q03954 IMP2'YIL154C 1041 nt10.59□□□□□ -0.71
SPC19Q03954 GBP2YCL011C 1284 nt10.59□□□□□ -0.71
SPC19Q03954 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.58□□□□□ -0.72
SPC19Q03954 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.58□□□□□ -0.72
SPC19Q03954 PUS2YGL063W 1113 nt10.56□□□□□ -0.72
SPC19Q03954 RTF1YGL244W 1677 nt10.56□□□□□ -0.72
SPC19Q03954 BOP3YNL042W 1191 nt10.55□□□□□ -0.72
SPC19Q03954 TCD2YKL027W 1344 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC19Q03954 DSK2YMR276W 1122 nt10.52□□□□□ -0.73
SPC19Q03954 FMP52YER004W 696 nt10.46□□□□□ -0.73
SPC19Q03954 YDR433WYDR433W 441 nt10.45□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 RRD1YIL153W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 PIB2YGL023C 1908 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC19Q03954 DED1YOR204W 1815 nt10.35□□□□□ -0.75
SPC19Q03954 YCL042WYCL042W 360 nt10.34□□□□□ -0.75
SPC19Q03954 PCM1YEL058W 1674 nt10.34□□□□□ -0.75
SPC19Q03954 FMP45YDL222C 930 nt10.33□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 SIM1YIL123W 1431 nt10.33□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 CWP1YKL096W 720 nt10.32□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 SNF6YHL025W 999 nt10.31□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 MXR2YCL033C 507 nt10.31□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 LCB1YMR296C 1677 nt10.31□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 NCP1YHR042W 2076 nt10.29□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 PTK1YKL198C 1989 nt10.29□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 ERV46YAL042W 1248 nt10.28□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
SPC19Q03954 ADH2YMR303C 1047 nt10.27□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 YPR011CYPR011C 981 nt10.27□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 YKR040CYKR040C 504 nt10.26□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 LPX1YOR084W 1164 nt10.26□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 BSP1YPR171W 1731 nt10.26□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 SOR2YDL246C 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 SOR1YJR159W 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 YFL054CYFL054C 1941 nt10.23□□□□□ -0.77
SPC19Q03954 BIO4YNR057C 714 nt10.2□□□□□ -0.78
SPC19Q03954 SSN3YPL042C 1668 nt10.19□□□□□ -0.78
SPC19Q03954 FRD1YEL047C 1413 nt10.15□□□□□ -0.79
SPC19Q03954 ERF2YLR246W 1080 nt10.13□□□□□ -0.79
SPC19Q03954 YIH1YCR059C 777 nt10.11□□□□□ -0.79
SPC19Q03954 RNQ1YCL028W 1218 nt10.1□□□□□ -0.79
SPC19Q03954 SPT8YLR055C 1809 nt10.1□□□□□ -0.79
SPC19Q03954 YLL053CYLL053C 459 nt10.07□□□□□ -0.8
SPC19Q03954 UBX6YJL048C 1191 nt10.05□□□□□ -0.8
SPC19Q03954 DIC1YLR348C 897 nt10.05□□□□□ -0.8
SPC19Q03954 LYS4YDR234W 2082 nt10.05□□□□□ -0.8
SPC19Q03954 CRR1YLR213C 1269 nt10.04□□□□□ -0.8
SPC19Q03954 BOR1YNL275W 1731 nt10.02□□□□□ -0.8
SPC19Q03954 HEM12YDR047W 1089 nt10□□□□□ -0.81
SPC19Q03954 YFL067WYFL067W 528 nt10□□□□□ -0.81
SPC19Q03954 FTR1YER145C 1215 nt9.99□□□□□ -0.81
SPC19Q03954 UME6YDR207C 2511 nt9.99□□□□□ -0.81
SPC19Q03954 YLR235CYLR235C 399 nt9.98□□□□□ -0.81
SPC19Q03954 DDR2YOL052C-A 186 nt9.98□□□□□ -0.81
SPC19Q03954 PTH1YHR189W 573 nt9.96□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 ATF2YGR177C 1608 nt9.95□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 SWE1YJL187C 2460 nt9.94□□□□□ -0.82
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