Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CAP1Q01518 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAP1Q01518 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAP1Q01518 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAP1Q01518 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAP1Q01518 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAP1Q01518 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAP1Q01518 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CAP1Q01518 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CAP1Q01518 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CAP1Q01518 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAP1Q01518 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CAP1Q01518 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAP1Q01518 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CAP1Q01518 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CAP1Q01518 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CAP1Q01518 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CAP1Q01518 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CAP1Q01518 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CAP1Q01518 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CAP1Q01518 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CAP1Q01518 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CAP1Q01518 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CAP1Q01518 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CAP1Q01518 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAP1Q01518 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAP1Q01518 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CAP1Q01518 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CAP1Q01518 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CAP1Q01518 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CAP1Q01518 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CAP1Q01518 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CAP1Q01518 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CAP1Q01518 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CAP1Q01518 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CAP1Q01518 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAP1Q01518 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAP1Q01518 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAP1Q01518 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAP1Q01518 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAP1Q01518 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAP1Q01518 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAP1Q01518 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAP1Q01518 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAP1Q01518 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAP1Q01518 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CAP1Q01518 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAP1Q01518 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CAP1Q01518 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAP1Q01518 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CAP1Q01518 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CAP1Q01518 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CAP1Q01518 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAP1Q01518 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CAP1Q01518 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CAP1Q01518 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CAP1Q01518 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAP1Q01518 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAP1Q01518 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAP1Q01518 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAP1Q01518 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAP1Q01518 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAP1Q01518 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAP1Q01518 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAP1Q01518 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAP1Q01518 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAP1Q01518 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAP1Q01518 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAP1Q01518 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAP1Q01518 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAP1Q01518 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CAP1Q01518 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAP1Q01518 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CAP1Q01518 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CAP1Q01518 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CAP1Q01518 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAP1Q01518 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CAP1Q01518 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CAP1Q01518 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CAP1Q01518 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CAP1Q01518 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms