Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSF1Q00613 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSF1Q00613 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HSF1Q00613 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSF1Q00613 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSF1Q00613 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HSF1Q00613 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HSF1Q00613 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HSF1Q00613 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HSF1Q00613 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HSF1Q00613 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HSF1Q00613 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSF1Q00613 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSF1Q00613 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSF1Q00613 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSF1Q00613 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSF1Q00613 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSF1Q00613 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSF1Q00613 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSF1Q00613 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSF1Q00613 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSF1Q00613 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSF1Q00613 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSF1Q00613 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSF1Q00613 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSF1Q00613 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSF1Q00613 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSF1Q00613 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSF1Q00613 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSF1Q00613 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSF1Q00613 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSF1Q00613 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSF1Q00613 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSF1Q00613 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSF1Q00613 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HSF1Q00613 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HSF1Q00613 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HSF1Q00613 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HSF1Q00613 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSF1Q00613 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HSF1Q00613 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HSF1Q00613 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSF1Q00613 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSF1Q00613 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSF1Q00613 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSF1Q00613 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HSF1Q00613 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HSF1Q00613 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSF1Q00613 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms