Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP2P63027 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP2P63027 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP2P63027 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP2P63027 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP2P63027 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP2P63027 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP2P63027 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAMP2P63027 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP2P63027 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP2P63027 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAMP2P63027 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP2P63027 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP2P63027 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP2P63027 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP2P63027 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP2P63027 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP2P63027 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP2P63027 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP2P63027 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP2P63027 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP2P63027 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP2P63027 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP2P63027 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP2P63027 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP2P63027 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP2P63027 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP2P63027 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP2P63027 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP2P63027 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP2P63027 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP2P63027 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP2P63027 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAMP2P63027 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP2P63027 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP2P63027 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP2P63027 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP2P63027 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP2P63027 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP2P63027 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP2P63027 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP2P63027 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP2P63027 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP2P63027 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP2P63027 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP2P63027 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP2P63027 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP2P63027 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms