Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01547P58512 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01547P58512 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01547P58512 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01547P58512 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01547P58512 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01547P58512 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01547P58512 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01547P58512 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01547P58512 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01547P58512 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01547P58512 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01547P58512 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01547P58512 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms