Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNX16P57768 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNX16P57768 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX16P57768 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX16P57768 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX16P57768 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX16P57768 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX16P57768 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX16P57768 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX16P57768 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX16P57768 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX16P57768 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX16P57768 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX16P57768 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNX16P57768 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX16P57768 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNX16P57768 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX16P57768 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX16P57768 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX16P57768 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX16P57768 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX16P57768 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX16P57768 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX16P57768 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX16P57768 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX16P57768 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX16P57768 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX16P57768 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX16P57768 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX16P57768 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX16P57768 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX16P57768 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX16P57768 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX16P57768 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX16P57768 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX16P57768 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX16P57768 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX16P57768 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX16P57768 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX16P57768 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX16P57768 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX16P57768 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX16P57768 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX16P57768 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX16P57768 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX16P57768 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX16P57768 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX16P57768 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX16P57768 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX16P57768 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX16P57768 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX16P57768 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX16P57768 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX16P57768 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX16P57768 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX16P57768 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX16P57768 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX16P57768 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX16P57768 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX16P57768 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX16P57768 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX16P57768 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX16P57768 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX16P57768 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX16P57768 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX16P57768 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX16P57768 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX16P57768 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX16P57768 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX16P57768 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX16P57768 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX16P57768 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX16P57768 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX16P57768 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX16P57768 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX16P57768 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX16P57768 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX16P57768 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNX16P57768 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX16P57768 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX16P57768 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX16P57768 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX16P57768 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX16P57768 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX16P57768 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX16P57768 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX16P57768 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX16P57768 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX16P57768 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX16P57768 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX16P57768 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX16P57768 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX16P57768 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX16P57768 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX16P57768 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX16P57768 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX16P57768 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX16P57768 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX16P57768 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX16P57768 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms