Protein–RNA interactions for Protein: P56703

WNT3, Proto-oncogene Wnt-3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3P56703 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WNT3P56703 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WNT3P56703 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WNT3P56703 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WNT3P56703 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WNT3P56703 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WNT3P56703 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WNT3P56703 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WNT3P56703 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WNT3P56703 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WNT3P56703 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WNT3P56703 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WNT3P56703 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WNT3P56703 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WNT3P56703 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WNT3P56703 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WNT3P56703 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WNT3P56703 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WNT3P56703 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WNT3P56703 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WNT3P56703 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WNT3P56703 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WNT3P56703 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WNT3P56703 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WNT3P56703 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WNT3P56703 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
WNT3P56703 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WNT3P56703 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
WNT3P56703 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WNT3P56703 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WNT3P56703 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WNT3P56703 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WNT3P56703 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WNT3P56703 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WNT3P56703 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WNT3P56703 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WNT3P56703 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WNT3P56703 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WNT3P56703 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WNT3P56703 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WNT3P56703 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WNT3P56703 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WNT3P56703 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WNT3P56703 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WNT3P56703 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WNT3P56703 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WNT3P56703 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WNT3P56703 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WNT3P56703 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WNT3P56703 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WNT3P56703 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WNT3P56703 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WNT3P56703 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WNT3P56703 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WNT3P56703 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WNT3P56703 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WNT3P56703 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WNT3P56703 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3P56703 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3P56703 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WNT3P56703 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WNT3P56703 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WNT3P56703 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WNT3P56703 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WNT3P56703 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3P56703 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WNT3P56703 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WNT3P56703 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WNT3P56703 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WNT3P56703 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WNT3P56703 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WNT3P56703 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WNT3P56703 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WNT3P56703 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WNT3P56703 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WNT3P56703 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WNT3P56703 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WNT3P56703 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WNT3P56703 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WNT3P56703 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WNT3P56703 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WNT3P56703 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WNT3P56703 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WNT3P56703 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WNT3P56703 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WNT3P56703 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WNT3P56703 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WNT3P56703 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WNT3P56703 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WNT3P56703 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WNT3P56703 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WNT3P56703 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WNT3P56703 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WNT3P56703 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WNT3P56703 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WNT3P56703 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WNT3P56703 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WNT3P56703 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WNT3P56703 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
WNT3P56703 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms