Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC16A1P53985 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC16A1P53985 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC16A1P53985 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC16A1P53985 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC16A1P53985 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC16A1P53985 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC16A1P53985 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC16A1P53985 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC16A1P53985 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC16A1P53985 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC16A1P53985 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC16A1P53985 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC16A1P53985 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC16A1P53985 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC16A1P53985 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC16A1P53985 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC16A1P53985 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC16A1P53985 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC16A1P53985 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC16A1P53985 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC16A1P53985 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC16A1P53985 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC16A1P53985 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC16A1P53985 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC16A1P53985 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC16A1P53985 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC16A1P53985 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC16A1P53985 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC16A1P53985 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC16A1P53985 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLC16A1P53985 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC16A1P53985 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC16A1P53985 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms