Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 IRC15YPL017C 1500 nt11.4□□□□□ -0.59
SYF2P53277 ART5YGR068C 1761 nt11.39□□□□□ -0.59
SYF2P53277 GFD2YCL036W 1701 nt11.39□□□□□ -0.59
SYF2P53277 TAT1YBR069C 1860 nt11.38□□□□□ -0.59
SYF2P53277 SDH1YKL148C 1923 nt11.37□□□□□ -0.59
SYF2P53277 YMR090WYMR090W 684 nt11.36□□□□□ -0.59
SYF2P53277 TIR4YOR009W 1464 nt11.33□□□□□ -0.6
SYF2P53277 YOL037CYOL037C 354 nt11.33□□□□□ -0.6
SYF2P53277 NPL3YDR432W 1245 nt11.3□□□□□ -0.6
SYF2P53277 GIS3YLR094C 1509 nt11.29□□□□□ -0.6
SYF2P53277 PET9YBL030C 957 nt11.26□□□□□ -0.61
SYF2P53277 RTS2YOR077W 699 nt11.26□□□□□ -0.61
SYF2P53277 SCC4YER147C 1875 nt11.25□□□□□ -0.61
SYF2P53277 YCH1YGR203W 447 nt11.21□□□□□ -0.61
SYF2P53277 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.2□□□□□ -0.62
SYF2P53277 YMR057CYMR057C 372 nt11.16□□□□□ -0.62
SYF2P53277 FPS1YLL043W 2010 nt11.13□□□□□ -0.63
SYF2P53277 CUE1YMR264W 612 nt11.13□□□□□ -0.63
SYF2P53277 YLR281CYLR281C 468 nt11.12□□□□□ -0.63
SYF2P53277 PAC11YDR488C 1602 nt11.09□□□□□ -0.63
SYF2P53277 WHI5YOR083W 888 nt11.09□□□□□ -0.63
SYF2P53277 YJL152WYJL152W 360 nt11.07□□□□□ -0.64
SYF2P53277 YHL050CYHL050C 2094 nt11.02□□□□□ -0.64
SYF2P53277 YSC84YHR016C 1407 nt11.02□□□□□ -0.64
SYF2P53277 PCH2YBR186W 1695 nt11□□□□□ -0.65
SYF2P53277 GUT2YIL155C 1950 nt10.97□□□□□ -0.65
SYF2P53277 SEC11YIR022W 504 nt10.97□□□□□ -0.65
SYF2P53277 RRT12YCR045C 1476 nt10.96□□□□□ -0.65
SYF2P53277 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SYF2P53277 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SYF2P53277 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SYF2P53277 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SYF2P53277 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.94□□□□□ -0.66
SYF2P53277 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.94□□□□□ -0.66
SYF2P53277 PIB2YGL023C 1908 nt10.92□□□□□ -0.66
SYF2P53277 YIL100WYIL100W 354 nt10.91□□□□□ -0.66
SYF2P53277 YLR236CYLR236C 324 nt10.9□□□□□ -0.66
SYF2P53277 PUS2YGL063W 1113 nt10.89□□□□□ -0.67
SYF2P53277 YPR011CYPR011C 981 nt10.88□□□□□ -0.67
SYF2P53277 RRD1YIL153W 1182 nt10.86□□□□□ -0.67
SYF2P53277 DSK2YMR276W 1122 nt10.84□□□□□ -0.67
SYF2P53277 IDH1YNL037C 1083 nt10.84□□□□□ -0.67
SYF2P53277 DED1YOR204W 1815 nt10.83□□□□□ -0.68
SYF2P53277 YNL195CYNL195C 786 nt10.8□□□□□ -0.68
SYF2P53277 GBP2YCL011C 1284 nt10.8□□□□□ -0.68
SYF2P53277 IMP2'YIL154C 1041 nt10.79□□□□□ -0.68
SYF2P53277 NCP1YHR042W 2076 nt10.75□□□□□ -0.69
SYF2P53277 RTF1YGL244W 1677 nt10.73□□□□□ -0.69
SYF2P53277 FMP45YDL222C 930 nt10.73□□□□□ -0.69
SYF2P53277 FMT1YBL013W 1206 nt10.73□□□□□ -0.69
SYF2P53277 NVJ2YPR091C 2313 nt10.71□□□□□ -0.69
SYF2P53277 TCD2YKL027W 1344 nt10.7□□□□□ -0.7
SYF2P53277 MXR2YCL033C 507 nt10.7□□□□□ -0.7
SYF2P53277 ERV46YAL042W 1248 nt10.69□□□□□ -0.7
SYF2P53277 LPX1YOR084W 1164 nt10.69□□□□□ -0.7
SYF2P53277 YDR433WYDR433W 441 nt10.67□□□□□ -0.7
SYF2P53277 FMP52YER004W 696 nt10.67□□□□□ -0.7
SYF2P53277 LCB1YMR296C 1677 nt10.66□□□□□ -0.7
SYF2P53277 PTK1YKL198C 1989 nt10.65□□□□□ -0.7
SYF2P53277 BOP3YNL042W 1191 nt10.65□□□□□ -0.7
SYF2P53277 SOR2YDL246C 1074 nt10.61□□□□□ -0.71
SYF2P53277 SOR1YJR159W 1074 nt10.61□□□□□ -0.71
SYF2P53277 PCM1YEL058W 1674 nt10.6□□□□□ -0.71
SYF2P53277 ADH2YMR303C 1047 nt10.58□□□□□ -0.72
SYF2P53277 YKR040CYKR040C 504 nt10.57□□□□□ -0.72
SYF2P53277 FRD1YEL047C 1413 nt10.57□□□□□ -0.72
SYF2P53277 CWP1YKL096W 720 nt10.54□□□□□ -0.72
SYF2P53277 SNF6YHL025W 999 nt10.48□□□□□ -0.73
SYF2P53277 BIO4YNR057C 714 nt10.48□□□□□ -0.73
SYF2P53277 SIM1YIL123W 1431 nt10.48□□□□□ -0.73
SYF2P53277 LYS4YDR234W 2082 nt10.48□□□□□ -0.73
SYF2P53277 YCL042WYCL042W 360 nt10.46□□□□□ -0.73
SYF2P53277 SPP1YPL138C 1062 nt10.44□□□□□ -0.74
SYF2P53277 YIH1YCR059C 777 nt10.41□□□□□ -0.74
SYF2P53277 MOT3YMR070W 1473 nt10.4□□□□□ -0.74
SYF2P53277 RNQ1YCL028W 1218 nt10.36□□□□□ -0.75
SYF2P53277 YFL054CYFL054C 1941 nt10.35□□□□□ -0.75
SYF2P53277 YLL053CYLL053C 459 nt10.33□□□□□ -0.76
SYF2P53277 SPT8YLR055C 1809 nt10.33□□□□□ -0.76
SYF2P53277 CRR1YLR213C 1269 nt10.31□□□□□ -0.76
SYF2P53277 DIC1YLR348C 897 nt10.31□□□□□ -0.76
SYF2P53277 YJL225CYJL225C 5277 nt10.28□□□□□ -0.76
SYF2P53277 PTH1YHR189W 573 nt10.27□□□□□ -0.77
SYF2P53277 ERF2YLR246W 1080 nt10.27□□□□□ -0.77
SYF2P53277 ATF2YGR177C 1608 nt10.26□□□□□ -0.77
SYF2P53277 FTR1YER145C 1215 nt10.25□□□□□ -0.77
SYF2P53277 GAL1YBR020W 1587 nt10.22□□□□□ -0.77
SYF2P53277 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
SYF2P53277 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
SYF2P53277 MIC10YCL057C-A 294 nt10.21□□□□□ -0.77
SYF2P53277 TRM5YHR070W 1500 nt10.2□□□□□ -0.78
SYF2P53277 YLR235CYLR235C 399 nt10.18□□□□□ -0.78
SYF2P53277 SWE1YJL187C 2460 nt10.18□□□□□ -0.78
SYF2P53277 SNG1YGR197C 1644 nt10.18□□□□□ -0.78
SYF2P53277 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.16□□□□□ -0.78
SYF2P53277 RTG1YOL067C 534 nt10.16□□□□□ -0.78
SYF2P53277 TIM23YNR017W 669 nt10.15□□□□□ -0.78
SYF2P53277 HEM12YDR047W 1089 nt10.14□□□□□ -0.79
SYF2P53277 YFL067WYFL067W 528 nt10.14□□□□□ -0.79
SYF2P53277 BOR1YNL275W 1731 nt10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms