Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HK3P52790 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HK3P52790 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HK3P52790 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HK3P52790 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HK3P52790 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HK3P52790 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HK3P52790 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HK3P52790 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HK3P52790 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HK3P52790 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HK3P52790 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HK3P52790 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HK3P52790 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HK3P52790 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HK3P52790 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HK3P52790 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HK3P52790 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HK3P52790 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HK3P52790 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HK3P52790 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HK3P52790 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HK3P52790 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HK3P52790 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HK3P52790 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HK3P52790 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HK3P52790 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HK3P52790 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HK3P52790 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HK3P52790 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HK3P52790 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HK3P52790 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HK3P52790 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HK3P52790 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
HK3P52790 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HK3P52790 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HK3P52790 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HK3P52790 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HK3P52790 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HK3P52790 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HK3P52790 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HK3P52790 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HK3P52790 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HK3P52790 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HK3P52790 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HK3P52790 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HK3P52790 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HK3P52790 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HK3P52790 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HK3P52790 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HK3P52790 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HK3P52790 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HK3P52790 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HK3P52790 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HK3P52790 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HK3P52790 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HK3P52790 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HK3P52790 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HK3P52790 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HK3P52790 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HK3P52790 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HK3P52790 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HK3P52790 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HK3P52790 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HK3P52790 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HK3P52790 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HK3P52790 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HK3P52790 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HK3P52790 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HK3P52790 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HK3P52790 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HK3P52790 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HK3P52790 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HK3P52790 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HK3P52790 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HK3P52790 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HK3P52790 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HK3P52790 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HK3P52790 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HK3P52790 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HK3P52790 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HK3P52790 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HK3P52790 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HK3P52790 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HK3P52790 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HK3P52790 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HK3P52790 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HK3P52790 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HK3P52790 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HK3P52790 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HK3P52790 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HK3P52790 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HK3P52790 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HK3P52790 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HK3P52790 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HK3P52790 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HK3P52790 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HK3P52790 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HK3P52790 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HK3P52790 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms