Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCP4P48539 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCP4P48539 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCP4P48539 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCP4P48539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCP4P48539 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCP4P48539 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCP4P48539 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCP4P48539 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCP4P48539 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCP4P48539 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCP4P48539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCP4P48539 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCP4P48539 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCP4P48539 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCP4P48539 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCP4P48539 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCP4P48539 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCP4P48539 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCP4P48539 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCP4P48539 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCP4P48539 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCP4P48539 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCP4P48539 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCP4P48539 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCP4P48539 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCP4P48539 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCP4P48539 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCP4P48539 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCP4P48539 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCP4P48539 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCP4P48539 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCP4P48539 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCP4P48539 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCP4P48539 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCP4P48539 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCP4P48539 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCP4P48539 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCP4P48539 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCP4P48539 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCP4P48539 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCP4P48539 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCP4P48539 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCP4P48539 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCP4P48539 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCP4P48539 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCP4P48539 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PCP4P48539 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCP4P48539 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCP4P48539 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCP4P48539 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCP4P48539 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCP4P48539 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCP4P48539 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCP4P48539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCP4P48539 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCP4P48539 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCP4P48539 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCP4P48539 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCP4P48539 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCP4P48539 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCP4P48539 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCP4P48539 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCP4P48539 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCP4P48539 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCP4P48539 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCP4P48539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCP4P48539 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCP4P48539 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCP4P48539 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCP4P48539 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCP4P48539 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCP4P48539 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCP4P48539 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCP4P48539 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCP4P48539 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCP4P48539 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCP4P48539 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCP4P48539 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCP4P48539 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCP4P48539 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCP4P48539 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCP4P48539 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCP4P48539 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCP4P48539 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCP4P48539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCP4P48539 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCP4P48539 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCP4P48539 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCP4P48539 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCP4P48539 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCP4P48539 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCP4P48539 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PCP4P48539 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PCP4P48539 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PCP4P48539 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PCP4P48539 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PCP4P48539 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PCP4P48539 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PCP4P48539 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms