Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 PTK1YKL198C 1989 nt10.23□□□□□ -0.77
PGD1P40356 RSB1YOR049C 1065 nt10.2□□□□□ -0.78
PGD1P40356 SIS1YNL007C 1059 nt10.14□□□□□ -0.79
PGD1P40356 RRT12YCR045C 1476 nt10.14□□□□□ -0.79
PGD1P40356 BDH2YAL061W 1254 nt10.12□□□□□ -0.79
PGD1P40356 TRM9YML014W 840 nt10.09□□□□□ -0.79
PGD1P40356 YNL195CYNL195C 786 nt10.09□□□□□ -0.79
PGD1P40356 GFD2YCL036W 1701 nt10.07□□□□□ -0.8
PGD1P40356 RTS2YOR077W 699 nt10.06□□□□□ -0.8
PGD1P40356 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.05□□□□□ -0.8
PGD1P40356 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.05□□□□□ -0.8
PGD1P40356 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.03□□□□□ -0.8
PGD1P40356 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.03□□□□□ -0.8
PGD1P40356 YFL054CYFL054C 1941 nt10.02□□□□□ -0.81
PGD1P40356 ART5YGR068C 1761 nt10.02□□□□□ -0.81
PGD1P40356 CCT6YDR188W 1641 nt10.02□□□□□ -0.81
PGD1P40356 CUE1YMR264W 612 nt10□□□□□ -0.81
PGD1P40356 MCH5YOR306C 1566 nt9.99□□□□□ -0.81
PGD1P40356 SPT8YLR055C 1809 nt9.98□□□□□ -0.81
PGD1P40356 PET9YBL030C 957 nt9.96□□□□□ -0.82
PGD1P40356 SRB2YHR041C 633 nt9.95□□□□□ -0.82
PGD1P40356 NCP1YHR042W 2076 nt9.94□□□□□ -0.82
PGD1P40356 ALG12YNR030W 1656 nt9.93□□□□□ -0.82
PGD1P40356 YIL100WYIL100W 354 nt9.91□□□□□ -0.82
PGD1P40356 HSP60YLR259C 1719 nt9.89□□□□□ -0.83
PGD1P40356 LSM3YLR438C-A 270 nt9.85□□□□□ -0.83
PGD1P40356 YCH1YGR203W 447 nt9.84□□□□□ -0.83
PGD1P40356 SWE1YJL187C 2460 nt9.74□□□□□ -0.85
PGD1P40356 YLR236CYLR236C 324 nt9.73□□□□□ -0.85
PGD1P40356 GLK1YCL040W 1503 nt9.72□□□□□ -0.85
PGD1P40356 PST2YDR032C 597 nt9.69□□□□□ -0.86
PGD1P40356 YMR057CYMR057C 372 nt9.67□□□□□ -0.86
PGD1P40356 TIR4YOR009W 1464 nt9.66□□□□□ -0.86
PGD1P40356 WWM1YFL010C 636 nt9.65□□□□□ -0.86
PGD1P40356 DSK2YMR276W 1122 nt9.63□□□□□ -0.87
PGD1P40356 LCB1YMR296C 1677 nt9.63□□□□□ -0.87
PGD1P40356 NAR1YNL240C 1476 nt9.62□□□□□ -0.87
PGD1P40356 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.54□□□□□ -0.88
PGD1P40356 AAC1YMR056C 930 nt9.54□□□□□ -0.88
PGD1P40356 FUR4YBR021W 1902 nt9.52□□□□□ -0.89
PGD1P40356 PRP4YPR178W 1398 nt9.49□□□□□ -0.89
PGD1P40356 BIO4YNR057C 714 nt9.48□□□□□ -0.89
PGD1P40356 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.45□□□□□ -0.9
PGD1P40356 YEL076CYEL076C 651 nt9.45□□□□□ -0.9
PGD1P40356 YGR021WYGR021W 873 nt9.45□□□□□ -0.9
PGD1P40356 YLR464WYLR464W 651 nt9.45□□□□□ -0.9
PGD1P40356 LYS4YDR234W 2082 nt9.44□□□□□ -0.9
PGD1P40356 HOM6YJR139C 1080 nt9.43□□□□□ -0.9
PGD1P40356 DPS1YLL018C 1674 nt9.42□□□□□ -0.9
PGD1P40356 SHU1YHL006C 453 nt9.4□□□□□ -0.9
PGD1P40356 CMP2YML057W 1815 nt9.38□□□□□ -0.91
PGD1P40356 CYT2YKL087C 675 nt9.38□□□□□ -0.91
PGD1P40356 BMT6YLR063W 1098 nt9.38□□□□□ -0.91
PGD1P40356 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.38□□□□□ -0.91
PGD1P40356 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.37□□□□□ -0.91
PGD1P40356 BIO5YNR056C 1686 nt9.36□□□□□ -0.91
PGD1P40356 SIM1YIL123W 1431 nt9.36□□□□□ -0.91
PGD1P40356 RPM1RPM1 483 nt9.35□□□□□ -0.91
PGD1P40356 PBP1YGR178C 2169 nt9.34□□□□□ -0.91
PGD1P40356 MNP1YGL068W 585 nt9.33□□□□□ -0.92
PGD1P40356 RKM5YLR137W 1104 nt9.29□□□□□ -0.92
PGD1P40356 SNF1YDR477W 1902 nt9.27□□□□□ -0.93
PGD1P40356 YKR005CYKR005C 1578 nt9.24□□□□□ -0.93
PGD1P40356 YJL152WYJL152W 360 nt9.24□□□□□ -0.93
PGD1P40356 NPL3YDR432W 1245 nt9.23□□□□□ -0.93
PGD1P40356 HSL7YBR133C 2484 nt9.23□□□□□ -0.93
PGD1P40356 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.22□□□□□ -0.93
PGD1P40356 CCA1YER168C 1641 nt9.22□□□□□ -0.93
PGD1P40356 PCM1YEL058W 1674 nt9.2□□□□□ -0.94
PGD1P40356 FMP52YER004W 696 nt9.18□□□□□ -0.94
PGD1P40356 IRC24YIR036C 792 nt9.17□□□□□ -0.94
PGD1P40356 RAX1YOR301W 1308 nt9.15□□□□□ -0.94
PGD1P40356 ERF2YLR246W 1080 nt9.15□□□□□ -0.94
PGD1P40356 NDI1YML120C 1542 nt9.13□□□□□ -0.95
PGD1P40356 WSC2YNL283C 1512 nt9.12□□□□□ -0.95
PGD1P40356 CRR1YLR213C 1269 nt9.12□□□□□ -0.95
PGD1P40356 YGR259CYGR259C 441 nt9.11□□□□□ -0.95
PGD1P40356 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.11□□□□□ -0.95
PGD1P40356 RRD1YIL153W 1182 nt9.09□□□□□ -0.95
PGD1P40356 YAT1YAR035W 2064 nt9.06□□□□□ -0.96
PGD1P40356 DED1YOR204W 1815 nt9.06□□□□□ -0.96
PGD1P40356 YKL097CYKL097C 411 nt9.06□□□□□ -0.96
PGD1P40356 HEL2YDR266C 1920 nt9.05□□□□□ -0.96
PGD1P40356 HEM12YDR047W 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
PGD1P40356 SNF6YHL025W 999 nt9.04□□□□□ -0.96
PGD1P40356 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.02□□□□□ -0.97
PGD1P40356 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.02□□□□□ -0.97
PGD1P40356 YCL074WYCL074W 927 nt9.01□□□□□ -0.97
PGD1P40356 MIC10YCL057C-A 294 nt9□□□□□ -0.97
PGD1P40356 YOL037CYOL037C 354 nt8.99□□□□□ -0.97
PGD1P40356 SPT20YOL148C 1815 nt8.98□□□□□ -0.97
PGD1P40356 DUS1YML080W 1272 nt8.96□□□□□ -0.98
PGD1P40356 ADH2YMR303C 1047 nt8.96□□□□□ -0.98
PGD1P40356 SNG1YGR197C 1644 nt8.95□□□□□ -0.98
PGD1P40356 Q0182Q0182 405 nt8.95□□□□□ -0.98
PGD1P40356 YLR281CYLR281C 468 nt8.95□□□□□ -0.98
PGD1P40356 CWP1YKL096W 720 nt8.94□□□□□ -0.98
PGD1P40356 FMT1YBL013W 1206 nt8.92□□□□□ -0.98
PGD1P40356 ATF2YGR177C 1608 nt8.91□□□□□ -0.98
PGD1P40356 TCD2YKL027W 1344 nt8.89□□□□□ -0.99
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