Protein–RNA interactions for Protein: P38344

REI1, Cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REI1P38344 GFD2YCL036W 1701 nt13.19□□□□□ -0.3
REI1P38344 PCH2YBR186W 1695 nt13.18□□□□□ -0.3
REI1P38344 YGR021WYGR021W 873 nt13.17□□□□□ -0.3
REI1P38344 SEC11YIR022W 504 nt13.14□□□□□ -0.31
REI1P38344 HOM6YJR139C 1080 nt13.14□□□□□ -0.31
REI1P38344 GUT2YIL155C 1950 nt13.14□□□□□ -0.31
REI1P38344 SHU1YHL006C 453 nt13.13□□□□□ -0.31
REI1P38344 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.09□□□□□ -0.31
REI1P38344 RTS2YOR077W 699 nt13.08□□□□□ -0.32
REI1P38344 PET9YBL030C 957 nt13.07□□□□□ -0.32
REI1P38344 PAC11YDR488C 1602 nt13.04□□□□□ -0.32
REI1P38344 YSC84YHR016C 1407 nt13.04□□□□□ -0.32
REI1P38344 MNP1YGL068W 585 nt12.99□□□□□ -0.33
REI1P38344 YHL050CYHL050C 2094 nt12.99□□□□□ -0.33
REI1P38344 PIB2YGL023C 1908 nt12.98□□□□□ -0.33
REI1P38344 TIR4YOR009W 1464 nt12.97□□□□□ -0.33
REI1P38344 MOT3YMR070W 1473 nt12.97□□□□□ -0.33
REI1P38344 YCH1YGR203W 447 nt12.96□□□□□ -0.33
REI1P38344 CUE1YMR264W 612 nt12.96□□□□□ -0.33
REI1P38344 RKM5YLR137W 1104 nt12.94□□□□□ -0.34
REI1P38344 RRT12YCR045C 1476 nt12.91□□□□□ -0.34
REI1P38344 YMR057CYMR057C 372 nt12.88□□□□□ -0.35
REI1P38344 RTF1YGL244W 1677 nt12.83□□□□□ -0.36
REI1P38344 FPS1YLL043W 2010 nt12.83□□□□□ -0.36
REI1P38344 NPL3YDR432W 1245 nt12.77□□□□□ -0.37
REI1P38344 YIL100WYIL100W 354 nt12.77□□□□□ -0.37
REI1P38344 YNL195CYNL195C 786 nt12.77□□□□□ -0.37
REI1P38344 BOP3YNL042W 1191 nt12.72□□□□□ -0.37
REI1P38344 YKL097CYKL097C 411 nt12.71□□□□□ -0.37
REI1P38344 YLR236CYLR236C 324 nt12.69□□□□□ -0.38
REI1P38344 PTK1YKL198C 1989 nt12.68□□□□□ -0.38
REI1P38344 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.66□□□□□ -0.38
REI1P38344 YJL152WYJL152W 360 nt12.64□□□□□ -0.39
REI1P38344 NCP1YHR042W 2076 nt12.63□□□□□ -0.39
REI1P38344 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.58□□□□□ -0.4
REI1P38344 NVJ2YPR091C 2313 nt12.57□□□□□ -0.4
REI1P38344 YOL037CYOL037C 354 nt12.54□□□□□ -0.4
REI1P38344 LCB1YMR296C 1677 nt12.44□□□□□ -0.42
REI1P38344 YFL054CYFL054C 1941 nt12.37□□□□□ -0.43
REI1P38344 RRD1YIL153W 1182 nt12.36□□□□□ -0.43
REI1P38344 WHI5YOR083W 888 nt12.36□□□□□ -0.43
REI1P38344 YJL225CYJL225C 5277 nt12.35□□□□□ -0.43
REI1P38344 YOR139CYOR139C 393 nt12.34□□□□□ -0.43
REI1P38344 YLR281CYLR281C 468 nt12.32□□□□□ -0.44
REI1P38344 SPT8YLR055C 1809 nt12.32□□□□□ -0.44
REI1P38344 DED1YOR204W 1815 nt12.27□□□□□ -0.44
REI1P38344 FMP52YER004W 696 nt12.26□□□□□ -0.45
REI1P38344 IDH1YNL037C 1083 nt12.25□□□□□ -0.45
REI1P38344 GBP2YCL011C 1284 nt12.24□□□□□ -0.45
REI1P38344 PCM1YEL058W 1674 nt12.22□□□□□ -0.45
REI1P38344 LYS4YDR234W 2082 nt12.21□□□□□ -0.45
REI1P38344 FMT1YBL013W 1206 nt12.2□□□□□ -0.46
REI1P38344 SIM1YIL123W 1431 nt12.2□□□□□ -0.46
REI1P38344 TCD2YKL027W 1344 nt12.18□□□□□ -0.46
REI1P38344 ADH2YMR303C 1047 nt12.11□□□□□ -0.47
REI1P38344 BIO4YNR057C 714 nt12.1□□□□□ -0.47
REI1P38344 SWE1YJL187C 2460 nt12.1□□□□□ -0.47
REI1P38344 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.08□□□□□ -0.48
REI1P38344 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.08□□□□□ -0.48
REI1P38344 CWP1YKL096W 720 nt12.08□□□□□ -0.48
REI1P38344 BOR1YNL275W 1731 nt12.08□□□□□ -0.48
REI1P38344 SNF6YHL025W 999 nt12.06□□□□□ -0.48
REI1P38344 IMP2'YIL154C 1041 nt12.06□□□□□ -0.48
REI1P38344 DSK2YMR276W 1122 nt12.03□□□□□ -0.48
REI1P38344 PUS2YGL063W 1113 nt12.01□□□□□ -0.49
REI1P38344 MXR2YCL033C 507 nt12.01□□□□□ -0.49
REI1P38344 YDR433WYDR433W 441 nt12□□□□□ -0.49
REI1P38344 SOR2YDL246C 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
REI1P38344 SOR1YJR159W 1074 nt11.99□□□□□ -0.49
REI1P38344 FMP45YDL222C 930 nt11.98□□□□□ -0.49
REI1P38344 YPR011CYPR011C 981 nt11.98□□□□□ -0.49
REI1P38344 ERF2YLR246W 1080 nt11.94□□□□□ -0.5
REI1P38344 YIH1YCR059C 777 nt11.93□□□□□ -0.5
REI1P38344 CRR1YLR213C 1269 nt11.93□□□□□ -0.5
REI1P38344 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 YCL042WYCL042W 360 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 HSP60YLR259C 1719 nt11.91□□□□□ -0.5
REI1P38344 ERV46YAL042W 1248 nt11.88□□□□□ -0.51
REI1P38344 YLL053CYLL053C 459 nt11.87□□□□□ -0.51
REI1P38344 FRD1YEL047C 1413 nt11.86□□□□□ -0.51
REI1P38344 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.86□□□□□ -0.51
REI1P38344 RNQ1YCL028W 1218 nt11.86□□□□□ -0.51
REI1P38344 LPX1YOR084W 1164 nt11.85□□□□□ -0.51
REI1P38344 ATF2YGR177C 1608 nt11.83□□□□□ -0.52
REI1P38344 YKR040CYKR040C 504 nt11.83□□□□□ -0.52
REI1P38344 MIC10YCL057C-A 294 nt11.82□□□□□ -0.52
REI1P38344 HEM12YDR047W 1089 nt11.8□□□□□ -0.52
REI1P38344 UME6YDR207C 2511 nt11.78□□□□□ -0.52
REI1P38344 GLK1YCL040W 1503 nt11.78□□□□□ -0.52
REI1P38344 SNG1YGR197C 1644 nt11.77□□□□□ -0.53
REI1P38344 FTR1YER145C 1215 nt11.75□□□□□ -0.53
REI1P38344 FUR4YBR021W 1902 nt11.75□□□□□ -0.53
REI1P38344 CCA1YER168C 1641 nt11.75□□□□□ -0.53
REI1P38344 YFL067WYFL067W 528 nt11.73□□□□□ -0.53
REI1P38344 RAX1YOR301W 1308 nt11.73□□□□□ -0.53
REI1P38344 GAL1YBR020W 1587 nt11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.8 ms