Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 ART5YGR068C 1761 nt11.95□□□□□ -0.5
CAF4P36130 SDH1YKL148C 1923 nt11.94□□□□□ -0.5
CAF4P36130 GFD2YCL036W 1701 nt11.92□□□□□ -0.5
CAF4P36130 IRC15YPL017C 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
CAF4P36130 YOL037CYOL037C 354 nt11.87□□□□□ -0.51
CAF4P36130 PET9YBL030C 957 nt11.86□□□□□ -0.51
CAF4P36130 TIR4YOR009W 1464 nt11.86□□□□□ -0.51
CAF4P36130 RTS2YOR077W 699 nt11.85□□□□□ -0.51
CAF4P36130 SCC4YER147C 1875 nt11.84□□□□□ -0.51
CAF4P36130 TAT1YBR069C 1860 nt11.84□□□□□ -0.51
CAF4P36130 GIS3YLR094C 1509 nt11.83□□□□□ -0.52
CAF4P36130 YOR139CYOR139C 393 nt11.83□□□□□ -0.52
CAF4P36130 NPL3YDR432W 1245 nt11.81□□□□□ -0.52
CAF4P36130 YCH1YGR203W 447 nt11.81□□□□□ -0.52
CAF4P36130 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.76□□□□□ -0.53
CAF4P36130 YMR057CYMR057C 372 nt11.76□□□□□ -0.53
CAF4P36130 YJL152WYJL152W 360 nt11.74□□□□□ -0.53
CAF4P36130 CUE1YMR264W 612 nt11.7□□□□□ -0.54
CAF4P36130 PAC11YDR488C 1602 nt11.68□□□□□ -0.54
CAF4P36130 NVJ2YPR091C 2313 nt11.64□□□□□ -0.55
CAF4P36130 WHI5YOR083W 888 nt11.62□□□□□ -0.55
CAF4P36130 FPS1YLL043W 2010 nt11.62□□□□□ -0.55
CAF4P36130 YLR281CYLR281C 468 nt11.6□□□□□ -0.55
CAF4P36130 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.59□□□□□ -0.55
CAF4P36130 YSC84YHR016C 1407 nt11.59□□□□□ -0.55
CAF4P36130 YIL100WYIL100W 354 nt11.58□□□□□ -0.56
CAF4P36130 SEC11YIR022W 504 nt11.58□□□□□ -0.56
CAF4P36130 PCH2YBR186W 1695 nt11.55□□□□□ -0.56
CAF4P36130 YLR236CYLR236C 324 nt11.54□□□□□ -0.56
CAF4P36130 RRT12YCR045C 1476 nt11.51□□□□□ -0.57
CAF4P36130 YNL195CYNL195C 786 nt11.5□□□□□ -0.57
CAF4P36130 YHL050CYHL050C 2094 nt11.5□□□□□ -0.57
CAF4P36130 GUT2YIL155C 1950 nt11.49□□□□□ -0.57
CAF4P36130 PUS2YGL063W 1113 nt11.44□□□□□ -0.58
CAF4P36130 IDH1YNL037C 1083 nt11.44□□□□□ -0.58
CAF4P36130 GBP2YCL011C 1284 nt11.39□□□□□ -0.59
CAF4P36130 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.38□□□□□ -0.59
CAF4P36130 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.38□□□□□ -0.59
CAF4P36130 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.38□□□□□ -0.59
CAF4P36130 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.38□□□□□ -0.59
CAF4P36130 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.38□□□□□ -0.59
CAF4P36130 IMP2'YIL154C 1041 nt11.35□□□□□ -0.59
CAF4P36130 DSK2YMR276W 1122 nt11.35□□□□□ -0.59
CAF4P36130 RRD1YIL153W 1182 nt11.33□□□□□ -0.6
CAF4P36130 TCD2YKL027W 1344 nt11.3□□□□□ -0.6
CAF4P36130 PIB2YGL023C 1908 nt11.29□□□□□ -0.6
CAF4P36130 RTF1YGL244W 1677 nt11.28□□□□□ -0.6
CAF4P36130 YPR011CYPR011C 981 nt11.28□□□□□ -0.6
CAF4P36130 DED1YOR204W 1815 nt11.25□□□□□ -0.61
CAF4P36130 YDR433WYDR433W 441 nt11.25□□□□□ -0.61
CAF4P36130 BOP3YNL042W 1191 nt11.25□□□□□ -0.61
CAF4P36130 FMP52YER004W 696 nt11.21□□□□□ -0.61
CAF4P36130 FMP45YDL222C 930 nt11.2□□□□□ -0.62
CAF4P36130 MXR2YCL033C 507 nt11.2□□□□□ -0.62
CAF4P36130 FMT1YBL013W 1206 nt11.18□□□□□ -0.62
CAF4P36130 LPX1YOR084W 1164 nt11.16□□□□□ -0.62
CAF4P36130 ERV46YAL042W 1248 nt11.14□□□□□ -0.63
CAF4P36130 PCM1YEL058W 1674 nt11.14□□□□□ -0.63
CAF4P36130 NCP1YHR042W 2076 nt11.13□□□□□ -0.63
CAF4P36130 LCB1YMR296C 1677 nt11.12□□□□□ -0.63
CAF4P36130 CWP1YKL096W 720 nt11.11□□□□□ -0.63
CAF4P36130 ADH2YMR303C 1047 nt11.1□□□□□ -0.63
CAF4P36130 PTK1YKL198C 1989 nt11.09□□□□□ -0.63
CAF4P36130 YKR040CYKR040C 504 nt11.09□□□□□ -0.63
CAF4P36130 YCL042WYCL042W 360 nt11.06□□□□□ -0.64
CAF4P36130 SIM1YIL123W 1431 nt11.06□□□□□ -0.64
CAF4P36130 SOR2YDL246C 1074 nt11.05□□□□□ -0.64
CAF4P36130 SNF6YHL025W 999 nt11.05□□□□□ -0.64
CAF4P36130 SOR1YJR159W 1074 nt11.05□□□□□ -0.64
CAF4P36130 FRD1YEL047C 1413 nt11.01□□□□□ -0.65
CAF4P36130 BIO4YNR057C 714 nt10.98□□□□□ -0.65
CAF4P36130 YFL054CYFL054C 1941 nt10.94□□□□□ -0.66
CAF4P36130 YIH1YCR059C 777 nt10.91□□□□□ -0.66
CAF4P36130 YJL225CYJL225C 5277 nt10.89□□□□□ -0.67
CAF4P36130 RNQ1YCL028W 1218 nt10.87□□□□□ -0.67
CAF4P36130 LYS4YDR234W 2082 nt10.86□□□□□ -0.67
CAF4P36130 YLL053CYLL053C 459 nt10.85□□□□□ -0.67
CAF4P36130 SPP1YPL138C 1062 nt10.85□□□□□ -0.67
CAF4P36130 MOT3YMR070W 1473 nt10.83□□□□□ -0.68
CAF4P36130 ERF2YLR246W 1080 nt10.83□□□□□ -0.68
CAF4P36130 DIC1YLR348C 897 nt10.82□□□□□ -0.68
CAF4P36130 SPT8YLR055C 1809 nt10.81□□□□□ -0.68
CAF4P36130 PTH1YHR189W 573 nt10.79□□□□□ -0.68
CAF4P36130 CRR1YLR213C 1269 nt10.79□□□□□ -0.68
CAF4P36130 FTR1YER145C 1215 nt10.75□□□□□ -0.69
CAF4P36130 ATF2YGR177C 1608 nt10.74□□□□□ -0.69
CAF4P36130 YLR235CYLR235C 399 nt10.72□□□□□ -0.69
CAF4P36130 TRM5YHR070W 1500 nt10.71□□□□□ -0.69
CAF4P36130 GAL1YBR020W 1587 nt10.7□□□□□ -0.7
CAF4P36130 HEM12YDR047W 1089 nt10.7□□□□□ -0.7
CAF4P36130 YFL067WYFL067W 528 nt10.69□□□□□ -0.7
CAF4P36130 MIC10YCL057C-A 294 nt10.69□□□□□ -0.7
CAF4P36130 DDR2YOL052C-A 186 nt10.67□□□□□ -0.7
CAF4P36130 SWE1YJL187C 2460 nt10.66□□□□□ -0.7
CAF4P36130 TIM23YNR017W 669 nt10.66□□□□□ -0.7
CAF4P36130 SNG1YGR197C 1644 nt10.66□□□□□ -0.7
CAF4P36130 UME6YDR207C 2511 nt10.65□□□□□ -0.7
CAF4P36130 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.65□□□□□ -0.7
CAF4P36130 YLR179CYLR179C 606 nt10.63□□□□□ -0.71
CAF4P36130 AQY1YPR192W 918 nt10.62□□□□□ -0.71
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