Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PCK1P35558 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCK1P35558 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCK1P35558 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCK1P35558 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCK1P35558 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCK1P35558 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCK1P35558 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCK1P35558 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCK1P35558 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCK1P35558 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCK1P35558 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCK1P35558 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCK1P35558 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCK1P35558 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PCK1P35558 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCK1P35558 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCK1P35558 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCK1P35558 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCK1P35558 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCK1P35558 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCK1P35558 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCK1P35558 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCK1P35558 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCK1P35558 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCK1P35558 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCK1P35558 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCK1P35558 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCK1P35558 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCK1P35558 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCK1P35558 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCK1P35558 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCK1P35558 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCK1P35558 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCK1P35558 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCK1P35558 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCK1P35558 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PCK1P35558 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCK1P35558 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCK1P35558 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCK1P35558 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCK1P35558 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCK1P35558 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCK1P35558 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCK1P35558 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCK1P35558 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCK1P35558 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCK1P35558 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCK1P35558 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCK1P35558 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCK1P35558 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCK1P35558 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCK1P35558 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCK1P35558 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCK1P35558 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCK1P35558 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCK1P35558 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCK1P35558 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCK1P35558 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCK1P35558 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCK1P35558 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCK1P35558 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCK1P35558 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCK1P35558 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCK1P35558 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCK1P35558 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCK1P35558 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PCK1P35558 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCK1P35558 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCK1P35558 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCK1P35558 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCK1P35558 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCK1P35558 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCK1P35558 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCK1P35558 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCK1P35558 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCK1P35558 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCK1P35558 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCK1P35558 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCK1P35558 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCK1P35558 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCK1P35558 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCK1P35558 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCK1P35558 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCK1P35558 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCK1P35558 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCK1P35558 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCK1P35558 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PCK1P35558 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCK1P35558 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCK1P35558 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCK1P35558 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCK1P35558 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCK1P35558 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCK1P35558 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCK1P35558 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCK1P35558 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCK1P35558 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCK1P35558 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCK1P35558 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms