Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRR1AP35321 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRR1AP35321 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPRR1AP35321 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPRR1AP35321 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPRR1AP35321 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPRR1AP35321 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRR1AP35321 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPRR1AP35321 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPRR1AP35321 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPRR1AP35321 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRR1AP35321 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRR1AP35321 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPRR1AP35321 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPRR1AP35321 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms