Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC1P35052 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC1P35052 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC1P35052 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC1P35052 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC1P35052 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC1P35052 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPC1P35052 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC1P35052 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC1P35052 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC1P35052 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC1P35052 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC1P35052 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC1P35052 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC1P35052 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPC1P35052 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC1P35052 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC1P35052 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC1P35052 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC1P35052 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC1P35052 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC1P35052 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC1P35052 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC1P35052 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC1P35052 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC1P35052 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC1P35052 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC1P35052 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC1P35052 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC1P35052 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC1P35052 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC1P35052 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC1P35052 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC1P35052 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC1P35052 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC1P35052 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC1P35052 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC1P35052 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC1P35052 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC1P35052 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC1P35052 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC1P35052 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC1P35052 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC1P35052 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC1P35052 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC1P35052 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC1P35052 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC1P35052 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC1P35052 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC1P35052 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC1P35052 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC1P35052 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC1P35052 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC1P35052 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC1P35052 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC1P35052 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC1P35052 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPC1P35052 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC1P35052 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC1P35052 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPC1P35052 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC1P35052 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC1P35052 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC1P35052 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPC1P35052 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC1P35052 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPC1P35052 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC1P35052 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC1P35052 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC1P35052 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC1P35052 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC1P35052 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPC1P35052 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC1P35052 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC1P35052 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC1P35052 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC1P35052 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC1P35052 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC1P35052 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC1P35052 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC1P35052 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC1P35052 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC1P35052 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC1P35052 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC1P35052 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC1P35052 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC1P35052 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC1P35052 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC1P35052 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC1P35052 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC1P35052 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC1P35052 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC1P35052 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC1P35052 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC1P35052 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC1P35052 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC1P35052 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC1P35052 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC1P35052 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC1P35052 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms