Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 RTF1YGL244W 1677 nt10.34□□□□□ -0.75
MSK1P32048 SIS1YNL007C 1059 nt10.34□□□□□ -0.75
MSK1P32048 SRB2YHR041C 633 nt10.3□□□□□ -0.76
MSK1P32048 YHL050CYHL050C 2094 nt10.3□□□□□ -0.76
MSK1P32048 CCT6YDR188W 1641 nt10.27□□□□□ -0.77
MSK1P32048 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.25□□□□□ -0.77
MSK1P32048 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.25□□□□□ -0.77
MSK1P32048 BOP3YNL042W 1191 nt10.24□□□□□ -0.77
MSK1P32048 GFD2YCL036W 1701 nt10.24□□□□□ -0.77
MSK1P32048 ART5YGR068C 1761 nt10.21□□□□□ -0.78
MSK1P32048 RRT12YCR045C 1476 nt10.19□□□□□ -0.78
MSK1P32048 PTK1YKL198C 1989 nt10.19□□□□□ -0.78
MSK1P32048 RTS2YOR077W 699 nt10.18□□□□□ -0.78
MSK1P32048 LSM3YLR438C-A 270 nt10.17□□□□□ -0.78
MSK1P32048 PET9YBL030C 957 nt10.14□□□□□ -0.79
MSK1P32048 CUE1YMR264W 612 nt10.13□□□□□ -0.79
MSK1P32048 YNL195CYNL195C 786 nt10.13□□□□□ -0.79
MSK1P32048 BOR1YNL275W 1731 nt10.05□□□□□ -0.8
MSK1P32048 WWM1YFL010C 636 nt10.04□□□□□ -0.8
MSK1P32048 YCH1YGR203W 447 nt10.04□□□□□ -0.8
MSK1P32048 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.02□□□□□ -0.81
MSK1P32048 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.02□□□□□ -0.81
MSK1P32048 YIL100WYIL100W 354 nt10.01□□□□□ -0.81
MSK1P32048 NCP1YHR042W 2076 nt9.98□□□□□ -0.81
MSK1P32048 YFL054CYFL054C 1941 nt9.95□□□□□ -0.82
MSK1P32048 UME6YDR207C 2511 nt9.95□□□□□ -0.82
MSK1P32048 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.92□□□□□ -0.82
MSK1P32048 TIR4YOR009W 1464 nt9.91□□□□□ -0.82
MSK1P32048 SPT8YLR055C 1809 nt9.91□□□□□ -0.82
MSK1P32048 YMR057CYMR057C 372 nt9.9□□□□□ -0.82
MSK1P32048 YLR236CYLR236C 324 nt9.88□□□□□ -0.83
MSK1P32048 YGR021WYGR021W 873 nt9.81□□□□□ -0.84
MSK1P32048 HSP60YLR259C 1719 nt9.73□□□□□ -0.85
MSK1P32048 LCB1YMR296C 1677 nt9.73□□□□□ -0.85
MSK1P32048 PST2YDR032C 597 nt9.72□□□□□ -0.85
MSK1P32048 HOM6YJR139C 1080 nt9.72□□□□□ -0.85
MSK1P32048 SWE1YJL187C 2460 nt9.7□□□□□ -0.86
MSK1P32048 ALG12YNR030W 1656 nt9.69□□□□□ -0.86
MSK1P32048 MCH5YOR306C 1566 nt9.67□□□□□ -0.86
MSK1P32048 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.63□□□□□ -0.87
MSK1P32048 GLK1YCL040W 1503 nt9.61□□□□□ -0.87
MSK1P32048 NPL3YDR432W 1245 nt9.6□□□□□ -0.87
MSK1P32048 RKM5YLR137W 1104 nt9.58□□□□□ -0.88
MSK1P32048 YJL152WYJL152W 360 nt9.56□□□□□ -0.88
MSK1P32048 LYS4YDR234W 2082 nt9.55□□□□□ -0.88
MSK1P32048 MNP1YGL068W 585 nt9.54□□□□□ -0.88
MSK1P32048 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.51□□□□□ -0.89
MSK1P32048 SIM1YIL123W 1431 nt9.5□□□□□ -0.89
MSK1P32048 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.48□□□□□ -0.89
MSK1P32048 SHU1YHL006C 453 nt9.46□□□□□ -0.9
MSK1P32048 FUR4YBR021W 1902 nt9.45□□□□□ -0.9
MSK1P32048 DSK2YMR276W 1122 nt9.45□□□□□ -0.9
MSK1P32048 BIO4YNR057C 714 nt9.45□□□□□ -0.9
MSK1P32048 FMP52YER004W 696 nt9.42□□□□□ -0.9
MSK1P32048 PCM1YEL058W 1674 nt9.41□□□□□ -0.9
MSK1P32048 NAR1YNL240C 1476 nt9.4□□□□□ -0.91
MSK1P32048 PRP4YPR178W 1398 nt9.39□□□□□ -0.91
MSK1P32048 AAC1YMR056C 930 nt9.39□□□□□ -0.91
MSK1P32048 RRD1YIL153W 1182 nt9.38□□□□□ -0.91
MSK1P32048 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.36□□□□□ -0.91
MSK1P32048 YEL076CYEL076C 651 nt9.36□□□□□ -0.91
MSK1P32048 YLR464WYLR464W 651 nt9.36□□□□□ -0.91
MSK1P32048 DPS1YLL018C 1674 nt9.33□□□□□ -0.92
MSK1P32048 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.31□□□□□ -0.92
MSK1P32048 ERF2YLR246W 1080 nt9.29□□□□□ -0.92
MSK1P32048 CCA1YER168C 1641 nt9.27□□□□□ -0.92
MSK1P32048 CRR1YLR213C 1269 nt9.27□□□□□ -0.93
MSK1P32048 SNF6YHL025W 999 nt9.26□□□□□ -0.93
MSK1P32048 BMT6YLR063W 1098 nt9.26□□□□□ -0.93
MSK1P32048 DED1YOR204W 1815 nt9.24□□□□□ -0.93
MSK1P32048 RAX1YOR301W 1308 nt9.24□□□□□ -0.93
MSK1P32048 BIO5YNR056C 1686 nt9.23□□□□□ -0.93
MSK1P32048 ADH2YMR303C 1047 nt9.23□□□□□ -0.93
MSK1P32048 FMT1YBL013W 1206 nt9.22□□□□□ -0.93
MSK1P32048 TCD2YKL027W 1344 nt9.21□□□□□ -0.94
MSK1P32048 PBP1YGR178C 2169 nt9.2□□□□□ -0.94
MSK1P32048 CYT2YKL087C 675 nt9.2□□□□□ -0.94
MSK1P32048 CWP1YKL096W 720 nt9.2□□□□□ -0.94
MSK1P32048 GBP2YCL011C 1284 nt9.2□□□□□ -0.94
MSK1P32048 YKR005CYKR005C 1578 nt9.2□□□□□ -0.94
MSK1P32048 HEM12YDR047W 1089 nt9.19□□□□□ -0.94
MSK1P32048 SNF1YDR477W 1902 nt9.18□□□□□ -0.94
MSK1P32048 IDH1YNL037C 1083 nt9.18□□□□□ -0.94
MSK1P32048 YOL037CYOL037C 354 nt9.16□□□□□ -0.94
MSK1P32048 MIC10YCL057C-A 294 nt9.16□□□□□ -0.94
MSK1P32048 RPM1RPM1 483 nt9.13□□□□□ -0.95
MSK1P32048 WSC2YNL283C 1512 nt9.13□□□□□ -0.95
MSK1P32048 YIH1YCR059C 777 nt9.12□□□□□ -0.95
MSK1P32048 CMP2YML057W 1815 nt9.12□□□□□ -0.95
MSK1P32048 SNG1YGR197C 1644 nt9.1□□□□□ -0.95
MSK1P32048 IRC24YIR036C 792 nt9.1□□□□□ -0.95
MSK1P32048 YLL053CYLL053C 459 nt9.1□□□□□ -0.95
MSK1P32048 ATF2YGR177C 1608 nt9.09□□□□□ -0.95
MSK1P32048 YFL067WYFL067W 528 nt9.08□□□□□ -0.96
MSK1P32048 YGR259CYGR259C 441 nt9.08□□□□□ -0.96
MSK1P32048 WHI5YOR083W 888 nt9.07□□□□□ -0.96
MSK1P32048 SOR2YDL246C 1074 nt9.05□□□□□ -0.96
MSK1P32048 SOR1YJR159W 1074 nt9.05□□□□□ -0.96
MSK1P32048 RNQ1YCL028W 1218 nt9.05□□□□□ -0.96
MSK1P32048 YCL074WYCL074W 927 nt9.04□□□□□ -0.96
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