Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDC25CP30307 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDC25CP30307 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDC25CP30307 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDC25CP30307 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDC25CP30307 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDC25CP30307 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC25CP30307 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDC25CP30307 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDC25CP30307 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDC25CP30307 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDC25CP30307 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDC25CP30307 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDC25CP30307 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDC25CP30307 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDC25CP30307 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDC25CP30307 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC25CP30307 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC25CP30307 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC25CP30307 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC25CP30307 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC25CP30307 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC25CP30307 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDC25CP30307 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDC25CP30307 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC25CP30307 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC25CP30307 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC25CP30307 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDC25CP30307 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC25CP30307 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC25CP30307 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC25CP30307 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDC25CP30307 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDC25CP30307 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDC25CP30307 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDC25CP30307 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDC25CP30307 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDC25CP30307 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDC25CP30307 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDC25CP30307 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDC25CP30307 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDC25CP30307 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC25CP30307 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDC25CP30307 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDC25CP30307 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC25CP30307 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDC25CP30307 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC25CP30307 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDC25CP30307 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDC25CP30307 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDC25CP30307 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDC25CP30307 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CDC25CP30307 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDC25CP30307 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDC25CP30307 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDC25CP30307 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDC25CP30307 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDC25CP30307 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CDC25CP30307 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDC25CP30307 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDC25CP30307 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms