Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP5DP30049 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP5DP30049 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP5DP30049 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP5DP30049 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP5DP30049 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP5DP30049 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP5DP30049 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP5DP30049 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP5DP30049 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP5DP30049 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP5DP30049 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP5DP30049 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP5DP30049 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP5DP30049 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP5DP30049 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP5DP30049 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP5DP30049 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP5DP30049 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP5DP30049 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP5DP30049 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP5DP30049 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP5DP30049 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP5DP30049 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP5DP30049 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP5DP30049 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP5DP30049 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP5DP30049 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP5DP30049 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP5DP30049 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP5DP30049 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP5DP30049 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP5DP30049 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP5DP30049 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP5DP30049 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP5DP30049 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP5DP30049 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP5DP30049 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP5DP30049 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP5DP30049 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP5DP30049 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP5DP30049 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP5DP30049 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP5DP30049 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP5DP30049 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP5DP30049 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP5DP30049 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5DP30049 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP5DP30049 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms