Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CALRP27797 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALRP27797 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALRP27797 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALRP27797 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALRP27797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CALRP27797 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALRP27797 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALRP27797 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALRP27797 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALRP27797 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALRP27797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALRP27797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALRP27797 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALRP27797 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALRP27797 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALRP27797 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALRP27797 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALRP27797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALRP27797 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALRP27797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALRP27797 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALRP27797 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALRP27797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALRP27797 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALRP27797 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALRP27797 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALRP27797 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALRP27797 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALRP27797 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALRP27797 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALRP27797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALRP27797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALRP27797 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALRP27797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALRP27797 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALRP27797 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALRP27797 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALRP27797 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALRP27797 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALRP27797 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALRP27797 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALRP27797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALRP27797 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CALRP27797 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CALRP27797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CALRP27797 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALRP27797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALRP27797 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALRP27797 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALRP27797 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALRP27797 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALRP27797 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALRP27797 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALRP27797 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALRP27797 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALRP27797 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALRP27797 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALRP27797 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALRP27797 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALRP27797 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALRP27797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALRP27797 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALRP27797 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALRP27797 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALRP27797 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALRP27797 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALRP27797 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALRP27797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALRP27797 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALRP27797 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALRP27797 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALRP27797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALRP27797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALRP27797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALRP27797 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALRP27797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALRP27797 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALRP27797 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALRP27797 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALRP27797 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALRP27797 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALRP27797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALRP27797 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALRP27797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALRP27797 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CALRP27797 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CALRP27797 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALRP27797 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CALRP27797 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CALRP27797 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CALRP27797 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALRP27797 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALRP27797 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALRP27797 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALRP27797 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALRP27797 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALRP27797 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALRP27797 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALRP27797 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms