Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGB2P26583 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGB2P26583 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGB2P26583 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HMGB2P26583 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
HMGB2P26583 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGB2P26583 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGB2P26583 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGB2P26583 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGB2P26583 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGB2P26583 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGB2P26583 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGB2P26583 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGB2P26583 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HMGB2P26583 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HMGB2P26583 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMGB2P26583 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HMGB2P26583 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HMGB2P26583 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGB2P26583 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HMGB2P26583 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HMGB2P26583 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HMGB2P26583 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGB2P26583 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
HMGB2P26583 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HMGB2P26583 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HMGB2P26583 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
HMGB2P26583 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
HMGB2P26583 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HMGB2P26583 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HMGB2P26583 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HMGB2P26583 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
HMGB2P26583 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HMGB2P26583 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HMGB2P26583 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HMGB2P26583 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGB2P26583 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HMGB2P26583 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HMGB2P26583 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGB2P26583 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGB2P26583 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGB2P26583 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGB2P26583 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HMGB2P26583 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGB2P26583 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HMGB2P26583 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HMGB2P26583 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
HMGB2P26583 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
HMGB2P26583 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HMGB2P26583 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HMGB2P26583 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HMGB2P26583 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HMGB2P26583 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGB2P26583 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGB2P26583 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGB2P26583 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37■■■■□ 3.51
HMGB2P26583 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGB2P26583 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGB2P26583 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGB2P26583 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
HMGB2P26583 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
HMGB2P26583 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HMGB2P26583 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
HMGB2P26583 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
HMGB2P26583 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
HMGB2P26583 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HMGB2P26583 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGB2P26583 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HMGB2P26583 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HMGB2P26583 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGB2P26583 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
HMGB2P26583 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
HMGB2P26583 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HMGB2P26583 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HMGB2P26583 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HMGB2P26583 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HMGB2P26583 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HMGB2P26583 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms