Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHMLP26374 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHMLP26374 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHMLP26374 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHMLP26374 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHMLP26374 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHMLP26374 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CHMLP26374 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHMLP26374 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHMLP26374 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHMLP26374 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHMLP26374 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHMLP26374 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHMLP26374 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHMLP26374 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHMLP26374 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHMLP26374 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHMLP26374 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHMLP26374 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHMLP26374 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHMLP26374 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHMLP26374 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CHMLP26374 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHMLP26374 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHMLP26374 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHMLP26374 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHMLP26374 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHMLP26374 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHMLP26374 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHMLP26374 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHMLP26374 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHMLP26374 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHMLP26374 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHMLP26374 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHMLP26374 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHMLP26374 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHMLP26374 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHMLP26374 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHMLP26374 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHMLP26374 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHMLP26374 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHMLP26374 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHMLP26374 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHMLP26374 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHMLP26374 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHMLP26374 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHMLP26374 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHMLP26374 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHMLP26374 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHMLP26374 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHMLP26374 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHMLP26374 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHMLP26374 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHMLP26374 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHMLP26374 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHMLP26374 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHMLP26374 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHMLP26374 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMLP26374 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHMLP26374 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHMLP26374 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHMLP26374 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHMLP26374 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHMLP26374 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMLP26374 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMLP26374 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMLP26374 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMLP26374 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHMLP26374 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHMLP26374 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHMLP26374 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHMLP26374 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHMLP26374 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHMLP26374 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CHMLP26374 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHMLP26374 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHMLP26374 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHMLP26374 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHMLP26374 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMLP26374 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMLP26374 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHMLP26374 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHMLP26374 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHMLP26374 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHMLP26374 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHMLP26374 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHMLP26374 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHMLP26374 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHMLP26374 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHMLP26374 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHMLP26374 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHMLP26374 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHMLP26374 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHMLP26374 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHMLP26374 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMLP26374 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMLP26374 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMLP26374 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMLP26374 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHMLP26374 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms