Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTAFRP25105 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTAFRP25105 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTAFRP25105 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTAFRP25105 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTAFRP25105 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTAFRP25105 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTAFRP25105 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTAFRP25105 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTAFRP25105 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTAFRP25105 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTAFRP25105 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAFRP25105 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAFRP25105 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTAFRP25105 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTAFRP25105 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTAFRP25105 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAFRP25105 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTAFRP25105 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAFRP25105 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTAFRP25105 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTAFRP25105 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTAFRP25105 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTAFRP25105 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTAFRP25105 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTAFRP25105 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTAFRP25105 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTAFRP25105 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTAFRP25105 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTAFRP25105 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTAFRP25105 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTAFRP25105 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTAFRP25105 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTAFRP25105 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTAFRP25105 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTAFRP25105 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTAFRP25105 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTAFRP25105 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTAFRP25105 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTAFRP25105 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTAFRP25105 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTAFRP25105 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTAFRP25105 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTAFRP25105 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTAFRP25105 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTAFRP25105 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTAFRP25105 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTAFRP25105 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTAFRP25105 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTAFRP25105 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTAFRP25105 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAFRP25105 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTAFRP25105 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTAFRP25105 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTAFRP25105 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTAFRP25105 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTAFRP25105 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTAFRP25105 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTAFRP25105 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTAFRP25105 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTAFRP25105 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTAFRP25105 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTAFRP25105 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms