Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF4P23510 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF4P23510 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF4P23510 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF4P23510 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF4P23510 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF4P23510 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF4P23510 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF4P23510 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF4P23510 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF4P23510 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF4P23510 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF4P23510 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF4P23510 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF4P23510 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF4P23510 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF4P23510 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF4P23510 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF4P23510 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF4P23510 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF4P23510 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF4P23510 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFSF4P23510 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF4P23510 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF4P23510 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF4P23510 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF4P23510 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF4P23510 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF4P23510 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF4P23510 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF4P23510 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF4P23510 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF4P23510 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF4P23510 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF4P23510 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF4P23510 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF4P23510 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF4P23510 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF4P23510 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF4P23510 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms