Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNF1AP20823 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNF1AP20823 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNF1AP20823 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HNF1AP20823 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNF1AP20823 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HNF1AP20823 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HNF1AP20823 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1AP20823 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNF1AP20823 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HNF1AP20823 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HNF1AP20823 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNF1AP20823 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HNF1AP20823 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNF1AP20823 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNF1AP20823 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNF1AP20823 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNF1AP20823 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNF1AP20823 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNF1AP20823 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1AP20823 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNF1AP20823 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1AP20823 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNF1AP20823 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HNF1AP20823 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNF1AP20823 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNF1AP20823 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HNF1AP20823 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HNF1AP20823 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HNF1AP20823 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF1AP20823 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1AP20823 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1AP20823 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1AP20823 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1AP20823 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1AP20823 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1AP20823 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1AP20823 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1AP20823 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF1AP20823 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HNF1AP20823 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1AP20823 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNF1AP20823 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNF1AP20823 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNF1AP20823 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNF1AP20823 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNF1AP20823 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNF1AP20823 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNF1AP20823 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNF1AP20823 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms