Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GP1BBP13224 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GP1BBP13224 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GP1BBP13224 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GP1BBP13224 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GP1BBP13224 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GP1BBP13224 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GP1BBP13224 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GP1BBP13224 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GP1BBP13224 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GP1BBP13224 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GP1BBP13224 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GP1BBP13224 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GP1BBP13224 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GP1BBP13224 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GP1BBP13224 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GP1BBP13224 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GP1BBP13224 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GP1BBP13224 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GP1BBP13224 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GP1BBP13224 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GP1BBP13224 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GP1BBP13224 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GP1BBP13224 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GP1BBP13224 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GP1BBP13224 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GP1BBP13224 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GP1BBP13224 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GP1BBP13224 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GP1BBP13224 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BBP13224 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BBP13224 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GP1BBP13224 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GP1BBP13224 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GP1BBP13224 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GP1BBP13224 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GP1BBP13224 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GP1BBP13224 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GP1BBP13224 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GP1BBP13224 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GP1BBP13224 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GP1BBP13224 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GP1BBP13224 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GP1BBP13224 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms