Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA4P12838 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEFA4P12838 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA4P12838 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA4P12838 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEFA4P12838 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA4P12838 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEFA4P12838 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA4P12838 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA4P12838 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA4P12838 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DEFA4P12838 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEFA4P12838 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEFA4P12838 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEFA4P12838 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFA4P12838 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEFA4P12838 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA4P12838 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFA4P12838 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFA4P12838 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFA4P12838 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFA4P12838 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DEFA4P12838 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEFA4P12838 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFA4P12838 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFA4P12838 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA4P12838 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA4P12838 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEFA4P12838 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA4P12838 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA4P12838 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA4P12838 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEFA4P12838 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEFA4P12838 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms